通常、マレー語はラテン文字26文字で表記される。これはイギリス植民地時代からの伝統であり、それ以前はアラビア文字を元に作られたジャウィ文字が使われていた。イスラム伝来以前には、グランタ文字、カウィ文字等のインドのブラーフミー文字から派生した文字が使われていたという。今でも、ジャウィ語でジャウィ文字が専用されるほか、マレーシア国内のイスラム教徒からもジャウィ文字の存続を求める声があり、学校教育の場ではその学習が続けられている。ブルネイでは、ラテン文字とジャウィ文字がともに正書法として制定されている。インドネシア語ではラテン文字のみが使用される。この記事ではラテン文字を使用する。インドネシア語との比較は以下のとおり。