加え、平成20年(2008)からは目黒線の延伸、市営地下鉄グリーンラインの開業によって2社3路線が乗り入れるようになり、1日の平均乗降者数は約31万人(各社合計・H27横浜市統計書)と大幅に増加してきている。東急電鉄の前身は大正11年(1922)に設立された目黒蒲田電鉄で、横浜方面では姉妹会社の東京横浜電鉄により丸子多摩川駅(現多摩川駅)~神奈川駅(廃駅)を結ぶ神奈川線が大正15年(1926)に開業。これにともない日吉駅も同年に誕生した。東京横浜電鉄が神奈川線敷設工事の為の土取り場として最初に買収した土地が駅近くの日吉不動尊付近であったことから、日吉は東急電鉄(東京横浜電鉄)発祥の地とされている。駅の西側は放射状に住宅地が開発され、東側には日吉台の土地12万坪を東急が寄付する形で慶応義塾大学予科を誘致し、昭和9年(1934)に慶應義塾大学日吉キャンパスが開設、駅周辺の中核が形成された。平成3年(1991)にはホームが地下化されリニューアルし、<4層吹き抜けから、やわらかな光が差し込む明るく開放的な駅>として関東の駅百選に選定されている。