PCを他の用途に使えません。「次世代シークエンス解析スタンダード」(羊土社)という本を読んでたら、遺伝研のスパコンを使って解析できる、という話が。pipelineに登録。アセンブリなどは既に終了してるので、blastなどの高次解析が主目的です。Galaxyというインタフェース?を通しておこなうらしい。galaxyにアクセスしました。説明と違う...?検索してみると、こんな文章が。interfaceを用いて開発されており、遺伝研スパコン上のウェブサービスとして提供して来ました。Pipeline利用統計(追加資料)参照)。これは、高次解析は自分のPC上でおこなえよ、という意味ですよね?時間かけてデータをFTP転送したり、仮想環境構築したり、色々したけども無駄でした。ことで、どうしようか考え中。pipelineではなくて、少し面倒だけど正式に遺伝研スパコンのユーザー登録をしてみようかな。(追記2016.12.17)結局blastはWindowsでおこないました。readsのデータでも約12時間で終了しました。問題はnrなどのデカいデータベースを使うときで、その時はやはり遺伝研のスパコンを借りた方がよさそう。pipelineの高次解析Tweet広告を非表示にする関連記事2018-01-03去年の振り返りと2018年にやりたいこと2017年の振り返りと、今年2018年にやりたいこと。使わせてもらった次世代シーケンサー。RNA-seqデータの解析中。(9)月別アーカイブ注目記事はてなブログをはじめよう!Kyoshiro1225さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。