今は1検体数十万円かけてウンコを調べますので、最近は厳選ウンコしか調べません。[LKM博士]ツイート04/26メタボロミクス、ウンコロミクス・・・メタボロミクス(Metabolomics)ってなんや?という質問もあるので、もう一度簡単に説明。『細胞や微生物が作る代謝産物を網羅的に調べる学問』です。これまで、アミノ酸ならアミノ酸だけ、短鎖脂肪酸なら短鎖脂肪酸だけを対象に前処理して調べていたものが、多くの成分をまとめて一度に測定できるのです。網羅的に解析する学問の接尾語が○○オミクス(-omics)というのが合わさってできた造語です。その代謝産物のかたまり(試料)をメタボローム(Metabolome)と言います。とでもいうのでしょうか。最近、最もホットな研究手法の一つです。ヒトやマウスの細胞や大腸菌なら、代謝経路がほぼ解明されているので、結果が意味している事が解釈し易いのですが、ウンコ由来のメタボローム解析は解釈が極めて難しいのです。(分泌と吸収がある)が加わるのです。結果がこの三者の内、どれの影響を受けたのかが簡単にはわからないのです。いうことで、私は、この特殊な環境中の代謝産物を研究することとを、通常のメタボロミクスではなく、ウンコロミクスと提唱しておりました(http://lkm512-blog.com/2009/10/07/)。関係者の間では実際に使ってきました。先日のセミナー後の懇親会で、ウンコロミクスを世界基準にするためには、語源をウンコという日本語ではなく、きっちり英語をベースにする方が良いのではないかと意見を頂きました。先のブログでもFecal(糞便の)を語源にFecalomicsも提唱していたのですが何かパッとしません。『スカトロミクス(Scatolomics)!』Scatology(糞便学)が語源です。なんか生々しいですが、良いと思います。こんなの講演で話したら、また、聴衆の反応悪くなりそー。私が別の意味でウンコ好きと思われそうで少し心配です。[LKM博士]ツイート04/25笑わないサイエンティスト金曜日は大阪でのアジレント社主催のメタボロミクスセミナーで講演してきました。伊藤園の岡野谷さんと私がそれを使って行った応用研究成果を話しました。世界的に著名な先生方の間で話すので、一応、真面目に話す予定なのだが・・・」くだけた話をするのも真面目に話すのも同じスライドで話し方を変えるだけです。要するに、くだけた話をするのは、研究成果に直接関係ないが、実施するにあたり起こったウンコ的なエピソードを喋りまくるということです。迷いましたが、主催者がそう望んでいるので"中の上"レベル(工場見学やスーパーでの講演時の7割位)で臨みました。後半になるにつれ、皆さん慣れてきたようで、ある程度予定通りの反応でしたが、前半はつらかったです。当たり前ですが、聴衆は工場見学者とは人種が違います。終わってから関係者と色々分析すると(何しろ、アジレント社は世界トップクラスの分析機器メーカーですから何でも分析する??)、"こういう場では、サイエンティストは笑わない"という結論になりました。深く分析すると、笑ったら失礼という意識が強く、その気持ちが自分だけ笑うわけにはいかないと強固に笑いを押し消すように努める。笑い声は起きないないけど、顔は皆笑っているということです。「心構えができていない状態でガンガン来たので、皆、戸惑っていたに違いない。心を掴みながら進めれば良いのかもしれません。正式に依頼するので10月のシンポジウムで話して。」と学会での講演を依頼されました。ウンコネタが面白いので学会で話せと言われる事はないでしょうから、研究内容が面白いということだと信じています。[LKM博士]ツイート04/18今週は大変やタイトルの通りです。3か月ぶりに追い込まれています。今週は、月曜日、火曜日とこれまでと積み重ねてきた実験の仕上げの実験が2つあります。金曜日は大阪で開催されるメタボロミクスセミナーで講演します。自粛ムードで一度は中止を検討されたようですが、開催されるようです。威張ることではないですが、まだ何も準備しておりません。金曜日は午前からなので、木曜日中に大阪に移動するのですが、交通費と時間の節約のために、木曜日の午後は、京都の2つの共同研究先と打ち合わせが入っています。いうか自ら入れてしまいました。こちらも準備ができておりません。それでもって、水曜日は社内のテーマ発表の順番が回ってくる。準備どころか、準備をやる気が起こらない。木曜日の夜は、学生時代の先輩がやっている焼肉屋を訪問する。んー、どう考えてもまずい。私は、追い込まれ、やる気になれば謎のエネルギーが出てくるタイプ。ウンコ色の脳ミソが"やる気"を作り始めることでしょう。言い訳ですが、別にこれまでさぼっていたわけではありませんので。攻撃性が高まる傾向がありますので、極力話しかけないで下さいね。我々が実験を実施する上で最も恐れているものの一つです。最近は停電の方が怖いですが...。正式にはコンタミネーション(Contamination)の略で"汚染"を意味します。リーダーズ英和辞典でみると、1番目に「特に放射能による汚染」と書いてありますが、その話題は今日はやめておきます。試薬の汚染というと、何か汚い埃などが入ると思われるかもしれませんが、それもコンタミではありますが、実験以前の問題です。そのようなコンタミを防ぐため、生化学の実験室は部屋の窓は余程のことが無い限り開ける事はありませんし、器具の蓋の開け方、洗浄の仕方もリスクの少ない方法で実施します。我々が日々経験するコンタミは他の試薬などが無意識の内に少し混入するイメージが良いと思います。微生物実験ですと、培地中に目的と違う微生物が混入したりすること等を意味します。生化学研究は、コンタミが無い実験系で実施することが最低限の条件でしょう。細菌Aの機能を調べているのにBが入っていては何を調べているのかわからないですから。DNAを使う実験なども、うまくいかない場合、まずコンタミを疑って、試薬などを作り直すと成功することが殆どです。それにしても不思議です。日本人は実験中に英語で会話しているわけでもないのに、Contaminationという英語を使い、長いからと略して使っているのですから。日本語の"おせん"の方が3文字で短いのですがね。ところで、ウンコ実験の場合のコンタミとは存在するのでしょうか?そもそも食べカスと細菌と水分で構成されおり、存在自体がコンタミかもしれません。扱っていると、未消化の人参やキノコ類はコンタミのように思いますが、あれも立派なウンコの一部です。私は、採取時の"便器の水"が実験のデータを狂わすのでコンタミと思っています。私が実施する試験は、絶対に水につけないで採便するようお願いします。ウンコと水、水の方が汚染源という特殊な世界にいるということを再認識し、本日は終わりたいと思います。>>※所属・肩書は投稿当時のものです。