2018年7月号)はじめに肺炎球菌はヒトの上咽頭の常在菌としても存在している。菌血症など全身性感染症を引き起こす。肺炎球菌による感染症の多くは散発である。肺炎球菌による集団感染が報告されている1-3)。抗原性の違いにより95種以上の血清(莢膜)型に分類されている。locus)にコードされている。自身の染色体上への組換えが行われる。switchingもしばしばみられる。Institut製血清を用い莢膜膨化法により決定した。薬剤感受性試験は微量液体希釈法によって行った。type(ST)を決定した。次世代シーケンサーMiSeq(Illumina)を用いて全ゲノム配列を決定した。A病院の同一病棟で長期入院中の基礎疾患を持つ患者13名が肺炎を発症した。男性と女性はそれぞれ7名と6名であった。肺炎球菌性肺炎と診断された。細菌学的および全ゲノム解析を行った。同じ病棟に入院している患者全員に肺炎球菌ワクチンの接種歴がなかった。薬剤感受性およびST型13症例由来肺炎球菌の解析結果を表に示す。残りの4株は6A型であった。12株(10A型8株と6A型4株)は同一ST(ST9999)を示した。10A型1株はST9999とアリルxptと1塩基が異なる近縁タイプ(ST10024)であった。今回のクラスター肺炎症例は同一肺炎球菌による感染であることが示唆された。locusの解析による肺炎症例間の関連性を解明することが必要となった。同一であることが明らかとなった4)。switchingの原因となった組換え部位を決定した(図)。Dタイプ)はそれぞれ2タイプに分けられた。6A血清型CとDタイプは3株と1株であった。他のタイプの肺炎球菌の配列を比較した。血清型変換に関与しない組換えが起きたことが示唆された。locus下流のtransposaseまでの配列は10A型から6A型に変換していた。proteinをコードする遺伝子とその下流のdexB遺伝子の一部分の配列はふたたび6A型から10Aに戻る現象がみられた。短期間の間に複数回の遺伝子の組換えが発生したと考えられた。switchingが生じて異なる血清型を示す同一肺炎球菌によるクラスター肺炎感染事例を解析した。血清型が変換したことを明らかにした。血清型別解析は重視された。全ゲノム解析が必要になる。