細菌達が集塊を形成している状態をこう名付けている。歯科領域では、デンタルプラーク(歯垢)のことをさす。細菌がエコロジカルな関係性を保って社会的構造を構成して共生してゆく状態(このコンセプト)を強調して、この言葉を用いることがある。重層的構造から、バイオフィルム内の細菌へは抗生剤の浸透性が悪く、その効果が低い。故に、十分にバイオフィルム(プラーク)を破壊・除去してから、投薬や薬剤注入をすることが必要である。