あらすじ:かつて、誰にも強く言えない気弱な少女がいた。名前を、暁美ほむらと言った。心臓の病気でずっと入院していたのから復学した彼女は、そのせいで勉強も出来なかったし体力も人並み以下だった。塞ぎこんでいった少女は、不可思議な空間・結界へと迷いこむ。異形の怪物・魔女に襲われるのを打ち払ったのは、自分のクラスメイト・鹿目まどかとその先輩・巴マミだった。鹿目まどかはその頃の暁美ほむらにとって、太陽とも言える存在だった。変な名前だと卑下していた名前を肯定してくれた。頑張ってもっと格好良い自分になればいいと、励ましてくれた。彼女のようになれればいいと、そう...思っていた。ワルプルギスの夜を迎え、巴マミを喪い孤立したまどかはほむらの制止も聞かずに魔女に立ち向かい...死んでしまう。その運命を、ほむらは嘆いた。エントロピーを凌駕する願いをもって、暁美ほむらはキュゥべえと魔法少女としての契約を結ぶ。「私は、鹿目さんとの出逢いをやり直したい。彼女に守られる自分ではなく、彼女を守る自分になりたい!」そして、時間が巻き戻る。暁美ほむらが退院する以前まで。彼女は嬉々として鹿目まどかに魔法少女として接し、巴マミや鹿目まどかと共に魔女を打ち払おうとする。時間操作の特殊能力があっても人並み以下の力しか無かったほむらは、爆薬の作り方を独学で学び...二人の支援もあって魔女を倒せるようになる。その時の感慨はひとしおだった、まどかも人一倍共に喜んでくれた。...ワルプルギスの夜の果てにソウルジェムの濁りきったまどかは魔女になってしまう。その事実を受け入れられず、ほむらは時間を巻き戻す。キュゥべえに騙されていると知ったほむらは、巴マミや鹿目まどか・美樹さやかにもその事実を伝えるが、その世界で敵対していた佐倉杏子のコトもあって信じてもらえない。挙句美樹さやかが魔女になったのを受けて、魔法少女がやがて魔女になるその事実に錯乱した巴マミがその場にいた佐倉杏子のソウルジェムを破壊し、銃口をほむらに向けて撃とうとするのをまどかがマミのソウルジェムを破壊することで止める...そんな惨劇を引き起こすことになった。悲嘆に暮れる中で、迫り来るワルプルギスの夜に立ち向かおうと手を取り合って涙ながらに誓い合うほむらとまどか。後悔なんて、あるわけなかった。喩えワルプルギスの夜に力及ばず二人揃って打ち倒される結末であっても。共にソウルジェムを濁り切らせて魔女に変貌する最期の時を待つも、まどかは隠し持っていたグリーフシードでほむらのソウルジェムを回復させる。暁美ほむらが唯一...彼女にしか出来ない時間操作でこの運命を変えて欲しいと願うのだった。「約束するわ...絶対に貴女を救ってみせる。暁美ほむらの決意は固かった。最期に魔女になって死ぬのは嫌だと縋った親友の願いを、自らの手を汚してまで叶える程に。時間はまた巻き戻り、4周目を迎える。「誰も、未来を信じない。誰も、未来を受け止められない」ならば。鹿目まどかが魔法少女として契約を結ばないように、現れる魔女を全て自分の力だけで打ち払うしか無い。「もう、誰にも頼らない。戦って戦って、戦い抜いた。いつしかほむらという名前が似合う、心に焔を宿した少女へと彼女は変質していた。到来したワルプルギスの夜...暁美ほむらは一人で全てを背負いすぎた。結果としてその隙をキュゥべえにつかれ、事もあろうにほむらを救う為に、鹿目まどかはキュゥべえと契約し...魔法少女になってしまった。最高の魔法少女としての資質を秘めていた鹿目まどかは、ワルプルギスの夜を一撃で倒し...そして魔女になった。最大の敵を倒した結果は、それしかない。最悪の結末を背にほむらは去ってゆく。戦わないのかと問い掛けるキュゥべえに、ほむらは呟く。「私の戦場は、此処じゃない」5周目。「繰り返す...私は何度でも繰り返す。「同じ時間を何度も巡り、たった一つの出口を探す。何度悲劇を繰り返しても、彼女は永遠に続くかもしれない流転に決着をつけようと、再び一歩。今までのコトを想い出すことは決して無くても、今までと変わらず名前で呼んでくれる...かけがえの無い親友の為に。