県名は「永遠の吉祥」を意味する。県人民政府は口前鎮にある。明代には女真ウラ部がこの地を支配し、ウラ国と称されていた。1613年(万暦41年)以降はヌルハチの支配が及び後金の領地となった。1671年(康熙10年)、寧古塔副都統アンジュフが吉林城を建設、1727年(雍正5年)には永吉州が設置され1747年(乾隆12年)に吉林庁と改称、1882年(光緒8年に吉林府に昇格した。中華民国が成立すると1913年(民国2年)に吉林府は吉林県に降格、更に1929年(民国18年)には永吉県と改称された。2007年2月に2007年アジア冬季競技大会(「長春2007」)の山岳系競技(フリースタイル・スキー、クロスカントリースキー、バイアスロン、アルペンスキー、スノーボード)が永吉県北大湖鎮の北大湖スキー場で開催された。