(全数)1.2016年は2017年10月28日現在報告数。おける感染症の一覧」(http://www.niid.go.jp/niid/images/idwr/ydata/2016/NESIDtable2016.xls)を参照。3.1999年の報告数は1999年4月からの報告数である。部分の数値は2002年11月1日からの報告数である。部分の数値は2003年11月5日からの報告数である。部分の数値は2007年4月1日からの報告数である。部分の数値は2011年2月1日からの報告数である。部分の数値は2013年3月4日からの報告数である。部分の数値は2016年2月15日からの報告数である。10.年の区切りについては報告週対応表2016年を参照。(2018年1月5日現在報告数)。E型肝炎およびA型肝炎の1999~2003年11月4日までの数値は(急性)ウイルス性肝炎として報告されたものである。ウエストナイル熱(ウエストナイル脳炎を含む。(病原体がフレボウイルス属SFTSウイルスであるものに限る。0*鳥インフルエンザ(H5N1及びH7N9を除く。0*2003年11月5日より、乳児ボツリヌス症はボツリヌス症に含まれた。0*2013年4月1日より、病型が追加された。