1947年9月28日DC4型定期便が羽田へ週2便で就航。1949年9月28日B-377ストラトクルーザー(空飛ぶホテル)太平洋路線に就航。1952年DC6B型を日本便に投入。1959年9月7日パンアメリカン航空B707型ジェット機が日本の空に登場。1981年4月26日中止。東京・ホノルル・ロサンゼルスB707便を大阪へ延長、大阪便がスタート。初のB747型機羽田に就航。1975年4月9日〜1976年8月30日、沖縄へB707便運航。1976年4月26日B747SP第一便ロサンゼルス・羽田間に就航。1977年2月パナマックII(コンピューター予約システム)オンライン化。沖縄便再開ーB747型機投入、1978年運航中止。1977年4月28日B747フレイター(貨物専用)便就航。1980年1月15日運航中止。羽田から成田へ国際空港移転。大阪・ホノルルB747直行便就航。1984年5月12日運航中止。成田パンナム・ケイタリング(機内食調理工場)オープン。1979年4月1日IATA(国際航空運送協会)を脱退。1979年10月1日ワールド・ツアー・オペレーター(ジェットツアー)とホールセール業務提携。大阪・ロサンゼルス直行便をB747SPで開設。1980年6月23日運航中止。成田・北京B747SP便新設。全日空に九州・沖縄地区のGSA(営業総代理店)を委託。1981年4月1日IATA(国際航空運送協会)に復帰。大阪・ロサンゼルス直行B747SP週3便再開。成田・マニラB747週5便就航。成田・台北ロッキードL1011週3便就航。成田・ソウルロッキードL1011週3便就航。大阪・ソウルB747・B727週4便就航。成田・上海直行B747SP便就航。成田・サンフランシスコPA12便日本からの最終便。1991年12月4日パンナム消滅。