幕府転覆の企みありとの嫌疑を受けて波乱の生涯を遂げた革命児。称して町奉行の職を去った遠山金四郎景元は世俗を離れて僧となり帰雲と名乗った。尺八を手に江戸の町をひっそりと托鉢して歩く虚無僧の姿が噂に上がった。それと並行して凶悪事件が姿を消してゆく。油を体内に持つ太平洋のマッコウ鯨を追って、海外の大国が日本沿岸に出没して食糧と水と燃料の薪を求めて開国を迫ります。それが攘夷と開国、国を二分する争いになり、やがて、幕府の盾となる新撰組が生まれます。