Ligationを応用したゲノムアセンブリと、ヒトゲノム構造解析を行う、ゲノミクス専門の受託サービスを展開しています。Ligationにより、FFPEを含むすべてのサンプルからメガベースレンジのゲノム情報を生成し、これまでは不可能だった大規模で複雑な構造多型の検出と解析を行うことが可能です。Ligationによるゲノム構造解析に数多くの実績があります。Hi-Cと、FFPE用のFix-CTMはどちらも、数百bpsからMbpsのサイズでDNAを再配列することができます。SelvaTM解析では、大規模で複雑な構造多型を、高い信頼性で検出し、グラフィカルに解析することができます。Hi-CまたはFix-CTMでそれぞれ処理したのち、シーケンシングし、SelvaTMソフトウェアで解析した結果、検出された第17番染色体内の構造多型を示しています。Fix-CTMおよびSelvaTMを検証するために、腫瘍率が異なる、複数のがんのタイプのFISH結果をもつ、12のFFPE腫瘍サンプルを用いて解析を行いました。DNA/RNAシークエンスによる追加検証で、SelvaTMのエラーネガティブコールではなく、FISHのエラーポジティブコールであったことが判明しました。サンプルNo.7では、SelvaTMはFISHによって検出できなかったROS融合、MYO5C-ROS1をコールしました。大規模かつ複雑な構造多型を検出して解析するためには、ブレイクポイントをカバーするゲノム情報と、リファレンスゲノム内でそれらを正確に整列させる必要があります。FFPEはその保存過程で、DNAが破壊され、インサートのサイズが大きく減少するため、ショートリードシーケンシングでは、大規模な構造多型を検出して解析することは不可能です。Genomics社の受託サービスにお任せください!お客様のニーズに合わせ、3つのサービスとキットをそろえています。Hi-Cキット(+Selva解析)1と2では、お客様はサンプルを送付するだけで、ライブラリ作成、シークエンス、Selvaによるゲノム構造解析までを全て受託で行います。3では、ご自身でライブラリ作成、シークエンスを行うことができます。Hi-Cキットには必要な試薬が含まれています。Selvaによる構造多型の検出を行うオプションもあります。結果レポート含まれるサービス内容Hi-Cライブラリ作成キット(追加オプション:SelvaTM解析)シークエンスはお客様が行いますSelvaTM解析:シークエンス後のデータから、Dovetail社がSelvaTMを用いて構造多型を検出し、解析レポート・解析後のFASTQファイルをご提供します。Ligationにより作成されたライブラリから、大規模かつ複雑な構造多型を検出し、インタラクティブなビューアで、グラフィカルに解析することができます。配列情報マルチ解析ソフトウェアGeneiousGeneiousは様々なバイオインフォマティクスツールを一つにまとめた多彩なソフトウェアです。rRNAを使用した生物多様性解析などが行えます。シークエンサーあるいはPacBio®シークエンサー向けの、ユニークなライブラリ調製用キットを提供しています。ユニークなライブラリ調製技術により、様々なタイプのDNAから効率よくシークエンスデータの取得が可能です。他社キットではあきらめていた解析にも、可能性が広がります。Reserved.特定商取引法に基づく表記プライバシー・ポリシ。