解析の流れと必要サンプル量Arraystar社の各種アレイを用いた受託解析サービスをご提供いたします。piRNAマイクロアレイの受託サービスを提供しています。Arrayは、スーパーエンハンサー(SE)領域から転写されたLncRNAを、対応するSE制御タンパク質コード遺伝子とともに体系的にプロファイルする様に設計されています。サービスを提供しています。包括的かつ、高品質でシステマチックなLncRNAの編集のためのプレミアムトランスクリプトーム、およびLncRNAデータベースを使用したLncRNAを基盤としています。スーパーエンハンサー領域は、dbSUPERデータベースに一覧化されています。SE-LncRNAは、LncRNAをスーパーエンハンサー領域にマッピングすることによって同定されます。正確な制御関係の確立を目的とした、SE-LncRNAとその標的遺伝子の同一アレイ上での同時プロファイリングを行います。SE-LncRNAの転写産物アイソフォームは、細胞あたり1つの転写産物で高い感度で、ユニークなエキソンまたはスプライスジャンクションアレイプローブ(図1)によって、明確に、特異的かつ確実に検出されます。SE-LncRNAのアノテーションは以下のものを含んでいます。標的コード遺伝子の注釈は以下の通りです。ID【アレイデザインの背景】Arraystar社は、ヒト、マウス用のSE-LncRNAアレイを開発し、SE-LncRNAとそのシスまたはトランス調節コード遺伝子を同じアレイ上で包括的、系統的かつ高感度にプロファイリングします。SE-LncRNAは、スーパーエンハンサーとともに、転写因子トラッピング、クロマチンルーピング、クロマチン修飾、PolIIローディング、および転写抑制因子の放出のメカニズムによって近くの遺伝子発現を活性化します(図1)。SE-LncRNAは、標的遺伝子をトランス活性化することが増えています[1]。SE-LncRNAは、多くのヒト疾患と関連しており、それらの発現は深刻な表現型の変化を示しています[1-3]。最終的に細胞型、細胞の同一性、および疾患を決定する多様な遺伝子発現プログラムにおいて主要な調節的役割を果たしています。SE-LncRNAのCERNAおよびDRRRNAは、マスター転写因子MyoDおよび筋形成遺伝子を自己調節して筋形成をオンにします[2]。多くのSE-LncRNAはがんと密接に関係しています。良い例は、MYC遺伝子の上流にあるCCAT1-Lです。それは、エンハンサー・プロモーターループ形成を媒介して、MYC発現を活性化し、そして結腸直腸がんの進行を促進させます[3]。癌遺伝子を同時にプロファイリングするためのSE-LncRNAプロファイリングソリューションを開発し、それらの制御下にあるSE-lncRNAおよびコード遺伝子の調査を加速させます。トランスクリプトームデータベースから得たゴールドスタンダードのLncRNAと信頼できるLncRNA。スーパーエンハンサーと重複したLncRNAは、SE-LncRNAとして同定され、アノテーションが付けられている。5]に由来するエンハンサーLncRNA。Super-lncRNAはクロマチン構成に影響を及ぼし、スーパーエンハンサー[6]に関連する重要な組織特異的遺伝子の空間的な増幅部位として機能する。標的コード遺伝子として収集する。これらの遺伝子は、TFチェックポイントデータベース由来の3,153の転写因子(TF)、およびブッシュマンラボデータベース由来の1,448のがん遺伝子を含む。トランスクリプトームデータベースから得たゴールドスタンダードのLncRNAと信頼できるLncRNA。スーパーエンハンサーと重複したLncRNAは、SE-LncRNAとして同定され、アノテーションが付けられている。標的コード遺伝子として収集する。これらの遺伝子は、TFチェックポイントデータベース由来の2,883の転写因子(TF)、およびSBCDDBデータベース由来の593のがん遺伝子を含む。F-AS-SELNCM-[サンプル数]*本サイトの情報は、Arraystar社のHomepageの情報を一部引用しております。