反論に相当するレター。著者はその前に読んだStroblさんの共同研究者らしい。パーミュテーション・ベースの変数重要度をめぐって陣営が分かれているらしい。ほうが安定しているっていうけど、MDGはカテゴリ数が多い変数で大きくなるし、予測子の間の相関によってバイアスを受ける。彼らの使ったデータの変数はSNPsだから、カテゴリ数が変数によってちがうし、ナントカカントカ(理解不能)のせいで相関がある。安定してりゃいいってもんじゃないよ。(いま調べてみたら、ゲノムの塩基配列のなかで変異がみられる場所のことをSNPというのだそうだ。生まれながらの文系なのに、なんでこんなの話を読まねばならんのか)それに、安定性について考えるんならカテゴリごとの頻度が大事よ。MDGはカテゴリの頻度分布によって影響されちゃうのだ。いうわけで、人工データによるシミュレーションでMDAの有用性を示している。面倒になっちゃったのでメモは省略。ランダム・フォレストにおけるパーミュテーション・ベースの変数重要度に着せられた汚名をそそぐ。