幕府と朝廷の関係は、朝廷には「天皇」、幕府には「将軍」と国の頂点になるのが、二人存在していた形になるからです。昔から天皇に権威があるものと考えられてきた背景がある為、幕府が実権を握っていたとはいえ政治に関して「天皇」の存在がある朝廷はかなり関わってきた事もわかります。幕府からすれば、朝廷をトップと考える藩が多くでてきて反幕を掲げてしまわれる事の方が問題と考えていたと思います。できるだけ関係を温和な状態でいる事を考えて政治を行っていたと思います。尊皇論の高まり尊皇論は、「天皇」を頂点とする体制への話がでてくる。「武」の政治から「文」の政治を良いとする考え方が多くでてきてしまう。実際には、これを好機と考えていた藩もあったと思われます。実際にここから、徳川幕府にヒビが入ってったとも考える事ができます。