ゲノム配列(dna.toplevel)をダウンロードする。Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa.gzマッピングには必要としないが、マッピングされたリードを遺伝子領域ごとに集計するときにアノテーションファイルも必要である。GTF)も合わせてダウンロードしておく。データ(*.fastq.gz)とゲノムの配列データ(Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa)を揃えたら、次にゲノムの配列データのインデックスを作成する。