生物の中でも人間や動物の消化管内に生息している腸内細菌の働きを増強し、その生理活動の促進や増強によってもたらされる有用な効果を最大限に引き出す効果があるとみなされているものや、それらの微生物を含み、動物の健康維持に有益とされている物質の総称です。代表的なものにビフィズス菌、乳酸菌といった微生物やこれらを含むヨーグルトや乳製品などがあります。がんリスク低減作用なども報告されており、研究が進められています。プロバイオティクスの『プロ』には共生といった意味があります。これは細菌性感染症治療に用いられている抗生物質に対する考えから生じたもので、抗生物質が症状発症後に原因菌となる微生物を死滅させることによって症状を改善させることに対し、プロバイオティクスが善玉菌とされる微生物の成長を増強することによって有害事象を引き起こす悪玉菌の活動を抑えることによる疾病の発生予防効果や健康維持効果があるとされることによります。