FavoritesSummary生体高分子の存在下で形成される炭酸カルシウム結晶の沈殿および特性形成のためのプロトコルについて述べた。here.Abstractバイオミネラリゼーションは、有機分子の存在下での鉱物の形成であり、多くの場合、生物の機能的および/または構造的役割に関連する。これは複雑なプロセスであり、したがって、単純なインビトロ、システムは、バイオミネラリゼーションプロセスに対する単離分子の影響を理解するために必要とされます。多くの場合、バイオミネラリゼーションは細胞外マトリックス中の生体高分子によって導けられる。マイクロラマンの沈殿に対する蒸気拡散法を用いて特性評価を行い、結晶中の生体高分子の量を測定するための紫外線可視(UV/Vis)吸光度。この方法では、単離された生体高分子を塩化カルシウム溶液に溶解し、固体炭酸アンモニウムの分解に起因する気体アンモニアおよび二酸化炭素に暴露する。炭酸カルシウムの溶解性積に達した条件下で、炭酸カルシウム沈殿物や結晶が形成されます。炭酸カルシウムは、熱力学的安定性が異なる異なる多形を有する:非晶質炭酸カルシウム、バセライト、アラゴネート、およびカルサイト。バイオポリマーが存在しない場合、クリーンな条件下では、炭酸カルシウムは、炭酸カルシウムの最も熱力学的に安定した多形であるカルサイト形態に主に存在する。この方法は、炭酸カルシウム結晶の形態および構造に対する生体高分子添加剤の影響を調べる。ここでは、細胞外細菌タンパク質TapAの研究を通じて、炭酸カルシウム結晶の形成に関するプロトコルを実証する。具体的には、実験設定と、光学顕微鏡や電子顕微鏡、ラマン分光法などの特性解析方法に焦点を当てています。Introductionバイオミネラリゼーションは、有機分子の存在下での鉱物の形成であり、多くの場合、生物の機能的および/または構造的役割に関連する。バイオミネラリゼーションは、磁気細菌1内のマグネタイトの形成のように細胞内であってもよいが、細胞外、ウニスパイク2における炭酸カルシウムの形成のように、コラーゲンに関連するヒドロキシアパタイトの骨3と歯4のアメロゲニンに関連するエナメル質の.バイオミネラリゼーションは、生物の多くのパラメータに依存する複雑なプロセスです。したがって、検討中のシステムを簡素化するためには、工程に対する別個の成分の影響を評価する必要がある。多くの場合、バイオミネラリゼーションは細胞外生体高分子の存在によって誘導される。ここで提示される方法の目的は、(1)インビトロで単離された生体高分子の存在下で炭酸カルシウム結晶を形成し、蒸気拡散法を用いる。(2)生体高分子が炭酸カルシウムの形態及び構造に及ぼす影響を研究する。有機添加物の存在下でインビトロで炭酸カルシウムを沈殿させる3つの主要な方法が5,6を使用する。我々が溶液法として言及する最初の方法は、カルシウムの可溶性塩(例えば、CaCl2)と炭酸の可溶性塩(例えば、炭酸ナトリウム)を混合することに基づいている。混合プロセスは、いくつかの方法で行われてもよい:多孔質膜7によって分離された3つの細胞を有する反応器内。ここで、各外部細胞は可溶性塩を含み、中央細胞は試験対象の添加剤を含む溶液を含有する。2+][CO3]2-]。追加の混合方法は、二重ジェット手順8である。この方法では、各可溶性塩を別々の注射器から添加剤を含む攪拌溶液に注入し、そこで炭酸カルシウムが沈殿する。ここで、注射およびしたがって混合速度は、混合が拡散によって制御される前の方法とは対照的に、よく制御される。CaCO3を結晶化するために使用される第2の方法は、キタノ法9である。3(s)+CO2(g)+H2O(l))に基づいている。ここで、CO2を固体形態でCaCO3を含む溶液に泡立て、平衡を左にシフトさせ、炭酸カルシウムを溶解させる。未溶解炭酸カルシウムを濾過し、所望の添加剤を重炭酸塩豊富な溶液に添加します。CO2は次いで蒸発させ、それによって反応を右にシフトさせ、添加剤の存在下で炭酸カルシウムを形成する。ここで説明する炭酸カルシウム結晶化の第3の方法は、蒸気拡散法10である。このセットアップでは、有機添加剤は、塩化カルシウムの溶液に溶解し、粉末状の炭酸アンモニウム近くの密閉室に配置される。炭酸アンモニウム粉末が二酸化炭素とアンモニアに分解すると、カルシウムイオンを含む溶液に拡散し(例えば、CaCl2)、炭酸カルシウムが析出します(図1参照)。炭酸カルシウム結晶は、低速沈殿または速い沈殿によって成長することができます。低速沈殿のために、CaCl2溶液中の添加剤を含む溶液を炭酸アンモニウム粉末の隣のデシケータに入れます。プロトコルで長さに記載されている速い沈殿において、添加液と炭酸アンモニウムの両方がマルチウェルプレートに近づけられます。低速の降水法は、より少ない核生成中心とより大きな結晶を生成し、速い沈殿は、より多くの核生成中心と小さな結晶をもたらすでしょう。上記の方法は、その技術的な複雑さ、制御レベル、および降水プロセスの速度で異なります。混合方法は、ダブルジェットと3セルシステムの両方に特別なセットアップ6を必要とします。+、Cl-)6の存在は避けられませんが、キタノ法では、カルシウムおよび(bi)炭酸塩は溶液中の唯一のイオンであり、追加の存在を伴いません。カウンターイオン(例えば、Na+、Cl-)。混合方法は比較的大量を必要とするため、高価なバイオポリマーの作業には適していません。ダブルジェットの利点は、溶液注入速度を制御することができ、他の方法と比較して迅速なプロセスであることです。キタノ法と蒸気拡散法の利点は、炭酸カルシウムの形成がCaCl2溶液の中へのCO2の拡散によって制御されるため、より遅い核生成および沈殿プロセスをプローブできることです。11歳,12.さらに、CO2の拡散による炭酸カルシウム形成は、生体内13、14、15における石灰化プロセスに類似してもよい。この方法では、明確に定義された分離された結晶が16に形成される。最後に、炭酸カルシウム形成に対する単一または複数の生体高分子の効果を試験することができる。これにより、炭酸カルシウム形成に対する一連の添加剤濃度の効果の系統的研究と、バイオポリマーの混合物の研究が可能になります。この方法は、添加剤の濃度と量の広い範囲での使用に適しています。μLであるため、この方法は利用可能な生体高分子の限られた量がある場合に有利である。最大容積は、より大きなウェルプレートのアクセシビリティ、またはCaCl2を含むプレートまたはビーカーを挿入するデシケータに依存します。以下に説明する方法は、タンパク質TapA17として選択された生体高分子を有する96ウェルプレートで働くために最適化されている。制御の準備と最適化きれいなガラス片を準備します。同じクリーニング手順を使用して、ガラス製品をクリーニングします。ダイヤモンドペンを使用して、ガラス顕微鏡スライドの断片を96ウェルプレートの井戸に収まるようにします。5ミリメートルの部分は、主にフィットする必要があります。ガラス片をトリプル蒸留水(TDW)でビーカーに入れ、水がガラススライドを覆い、バスソニネーターで10分間超音波処理を行います。水をデカントし、ガラススライドをカバーするためにエタノールを追加し、10分間バスソニケーターで超音波処理します。スライドとガラス製品を窒素ガスの流れで乾燥させ、130Wで10分間エアプラズマクリーナーに入れます。目的の実験条件下で行われる石灰化実験で使用されるCaCl2の濃度を最適化し、滑らかな面の石灰質結晶を豊富に含むサンプルを達成する(少なくともバテライトの数が少ない場合)。炭酸アンモニウム粉末で96ウェルプレートのコーナーで井戸を埋め、アルミ箔を使用してプレートをシールします。パラフィンフィルムでホイルを覆う。窒素ガスを使用して、残留炭酸アンモニウムをきれいにします。炭酸アンモニウムは、鼻や肺を刺激します;ヒュームフードの内側にのみ使用してください。ソリューションを準備します。このストック溶液は、マルチウェルプレート内のCaCl2溶液の濃度の勾配を調製するために使用されます。mLのストックソリューションは、実験全体に十分です。以前に切断し、洗浄したガラス片を5つの異なる井戸に置きます。中央に最も近い井戸を使用します。μLでガラス片を持つ各ウェルを充填します。2(ストック)を混合して、異なるウェル間でCaCl2の濃度勾配を増加させます。異なるサイズのウェルプレートを使用する場合は、CaCl2の濃度を調整して別々のカルサイト結晶を達成します(ステップ1.1.2.10、および「ディスカッション」セクションを参照)。mM濃度の増加するCaCl2勾配が使用されます。濃度範囲または試験した濃度の数を増やすには、追加のウェルを使用します。炭酸アンモニウム3xを含む各井戸のカバーを針で穿刺する。蓋を戻し、パラフィンフィルムで境界線を密封し、20時間インキュベーターで18°Cに保ちます。インキュベーションの後、フュームフードの内側に慎重に蓋を開け、ループで水/空気界面で形成された結晶を取り除きます。二重蒸留水(DDW)を含むビーカーにガラス片を転送するには、ツイザーを使用します。ビーカーからサンプルを取り出し、両面テープを使用してガラス片をペトリ皿の底に固定します。スライドの境界に触れる余分な水をティッシュワイプで乾かします。ペトリ皿を覆い、24時間デシケーターに入れます。ステレオスコープ(3.5倍倍)や直立光学顕微鏡(10x-40倍倍)でガラス片に形成された結晶を観察します。対照液がクリーンである場合、菱形結晶(最も可能性の高い石灰質)は光学顕微鏡で観察される(図2A)。3A,B,結晶化プロトコルを繰り返し、洗浄ステップ(1.1.1)が正しく実行されていることを確認します。専用の井戸以外のプレート上の領域に炭酸アンモニウムが存在しない場合は、より良い注意を払います。それ以外の場合は、次の手順に進みます。添加剤の存在下での結晶化CaCO3の結晶化に対する添加剤の効果を調べるために、(異なるウェルに)含まれるマルチウェルプレート、添加剤を含まない対照CaCl2溶液、および添加剤を含むCaCl2溶液を設定する。実験にはセクション1.1.2にあるCaCl2の最適濃度を使用します。以下のプロトコルは、以前の研究16で報告されたものと同様に最適な条件を使用します。ステップ1.1.2.1に記載されているように、炭酸アンモニウム粉末をプレートの隅に置きます。降水が発生する各井戸に、セクション1.1.1に記載されているように切断され、洗浄されたガラス片を配置します。つの反復を準備します。使用する添加剤が緩衝液中にある場合は、TDW水の代わりに90μLのバッファーをピペットします。添加物含有井戸を調製します。μLを加えてステップ1.2.5を繰り返します。添加剤が(TDWの代わりに)バッファー内にある場合は、目的の最終濃度を満たすために、添加剤の濃度をバッファーで事前に調整します。ピペットは、最初に添加剤、次にバッファを行います。8.0バッファー16が使用される。CaCl2に到達します。光学顕微鏡で得られたものよりも高い解像度で添加剤の存在下で形成された炭酸カルシウム結晶を観察します(ステップ1.1.2.10参照)。両面カーボンテープでアルミスタブに結晶を含むガラス片を取り付けます。sのためのAu/Pdの層とコート。加速度電圧で画像を取得します。注:図3Aは、適切な対照実験で形成された炭酸カルシウム結晶の代表的なSEM画像を示し、図4はタンパク質TapAの存在下で形成された炭酸カルシウム結晶の代表的な画像を示す。.マイクロラマン分光法を実行して、形成された炭酸カルシウムポリモーフを決定します。マイクロラマンは、粉末全体からではなく、単結晶からラマンスペクトルの収集を可能にします。目的の結晶を選択するには、顕微鏡の20倍の目的を使用してください。cm-1の範囲でラマンスペクトルを収集します。注:図5は、カルサイト(A)およびバテライト(B)の代表的なスペクトルを示す。アラゴニーのスペクトルについては、参照18を参照してください。使用する添加剤の消滅係数(ε)を検証/測定します。タンパク質の絶滅係数は、オンラインサーバー19によって与えることができる。絶滅係数が不明な場合は、異なる濃度で添加剤の吸光度を測定し、吸光度対濃度をプロットし、曲線の傾きから絶滅係数を計算します。結晶が形成されたガラス片の重量を量り、好ましくはマイクロバランスを用いる。mLにガラスから結晶をスクラップし、渦とサンプルを超音波処理します。サンプルを室温で24時間保存します。注意:酢酸は、皮膚や目の接触の場合に非常に危険です。注意して取り扱い、規則に従って処分します。結晶を削り取った後、ガラススライドの重量を量る。吸光度(A)スペクトルを測定します。nmで吸光度を測定し、その濃度(C)を、ビールランバート方程式を使用して計算します。使用して、結晶の中/上の添加剤の質量(m)を計算します。場合は、方程式Cを使用します。濃度がmol/Lの場合は、Cを適用するモル(n)を計算します。sはガラスから廃棄された炭酸カルシウム結晶の質量です。