第1番札所でもあるのです本殿の裏に回ると派手な色をした廟がありますがここに祀られているのが如意観音で「長崎西国一番」の文字が見えますちなみに清水寺のご本尊は開祖である慶順僧都が京都清水寺より奉持してきたといわれる「千手観音」ですその脇にある石段を上がると先ず目に付くのは「瑞光石」と名づけられた巨石お寺のHPによると「寺院建立の達成を千手観音に祈願していた慶順僧都が、東の方角に白く輝く雲のようなものが立ち昇るのを発見。不思議な場所で光を発していた大石が、現在も本堂の裏手に残されています。畳敷きの建物だとかそしてこれが5年をかけて大改装された後に国の重要文化財に指定された本堂ですお寺のHPによると「建物全体を解体し行われた修理では、調査検証も実施され長崎清水寺の本堂が非常に特徴のある建物であることが確認されました。