妻のミリヤナ・マルコヴィッチとは、大学在籍中に知り合う。彼女は翼賛政党である「ユーゴスラビア左翼連合」の党首を務め、夫の権力を支えた。多くの人々は、彼女がミロシェヴィッチの行動、ユーゴスラビアの政治に大きな影響を与えたと考えている。息子のマルコ・ミロシェビッチ(英語版)はその妻や子供とともにブルドーザー革命後にロシアのモスクワを経由してミロシェビッチ一家と親密な関係[1][2]だった中国の北京首都国際空港まで逃げるも外交問題となることを懸念した中国当局から入国を拒否された[3][4]。中国にはミロシェビッチの金庫番であるボルカ・ヴチッチ(英語版)によって巨額の財産がユーゴスラビアから持ち込まれていたとも報じられていた[5]。