Blog2016-01-05snpEffのアノテーション書式バイオインフォマティクスたびたびブログでもご紹介している、アノテーションソフトsnpEff、一年前の9月にバージョン4.0になったとご紹介しましたが、2015年1月現在のバージョンは4.2です。snpEffで付与されるアノテーションの書式は、以前は下記のような「EFF=...」でした。">現在のバージョンでは、デフォルトでは「ANN=...」に変更しています。">バージョン4.1でも、実行時に「-classic」オプションを使用することで、「EFF=...」の書式でアノテーションすることも可能です。古いバージョンと互換性を残してくれるのはうれしいですね。ANN書式が旧書式に比べ発展している点として、連続する変異を合わせた影響を考慮するなど、便利なアノテーションが増えているようなので、今後はぜひともANN書式を使いこなしていきたいです。書式の詳細については公式の説明をご覧ください。(1)memberid:amelieffid:Fuku-Iid:miwa-tid:hr-kid:fujinamisid:miya-yid:kubo-mid:ta-yid:yama_toid:yokokozuarchivesはてなブログをはじめよう!amelieffさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。