1999年5月「台湾の前途に関する決議文」採択。2000年総統選挙で党公認の陳水扁・呂秀蓮ペアが勝利。逮捕(1984年釈放)。2000年10月、張俊雄が民進党初の行政院長(首相)就任。2008年総統選挙で謝長廷・蘇貞昌ペアが、国民党の馬英九・蕭万長に敗れる。2001年12月の立法委員選挙で初の第一党に躍進。台日政党シンポジウムを挙行。2004年2月、中国のミサイル配備に反対する「人間の鎖」デモ。2004年総統選挙で陳水扁・呂秀蓮ペアが再選。2004年9月「エスニシティ決議文」採択。