一口に性染色体が関わる性決定といっても、その機構は一様ではない。この違いは、正常個体よりX染色体が1本過剰あるいは1本不足した個体での性表現での違いを見ると明確になる(表2)。5ページの表「キイロショウジョウバエの染色体構成と性」より作成。Goldscmidt(1955)による。Y染色体数は性決定に関係が無いので省略した。雄ヘテロ型には、XY型、XO型のほかにX,Y染色体が複数存在するXnYn型もある。XY型はヒトを含む哺乳類で一般的な性決定様式であり、ショウジョウバエを含む昆虫の一部でも見られる。両者の機構の違いは前述の通りである(表2)。elegansでは、XO型個体は雄となり、XX個体は雌雄同体となる。雄ヘテロ型生物における遺伝子量補償の機構もまた、生物種によって異なることが知られている[8]。哺乳類では雌のX染色体の片方を不活性化し、ショウジョウバエでは雄のX染色体の発現量を2倍化し、線形動物のXX雌雄同体個体は双方のX染色体の発現量を半減させる。それぞれの遺伝子量補償の機構は異なるが、結果として雌雄(あるいは雄と雌雄同体個体)の性染色体での遺伝子の発現量を等しくしている。