17年前に地球に飛来した特殊な力を持った7種類の石「セイクリッドセブン」。それは触れた者を特殊な能力者「セイクリッドテイカー」へと変える力を持っていた。その力を発動させる者は「悪石(アシ)」と呼ばれ、対してその力をコントロールする者は「善石(ヨシ)」と呼ばれる。セイクリッドテイカーの少年・丹童子アルマは、以前に力を暴走させて大勢に怪我を負わせて以来人を遠ざけていたが、彼の前に藍羽ルリが現れる。ルリはアルマに宿るセイクリッドセブンの力を、石の魔物「悪石」と戦うため貸して欲しいと申し出る。初めは断ったアルマだが、悪石に襲われた街を守るため、ルリによって本当の能力を解放させ「セイクリッドアルマ・リベレイター」へと変身し悪石を打ち砕いた。アルマは力を制御できた事から周囲を避けてきた自分を変えることを決意し、その一歩として若菜が部長を務める「鉱石部」に入部。「鉱石部」には学園を買い取り理事長に就任したルリと執事の鏡誠の姿もあった。莫大な資産を持つルリは、その財力で悪石達と戦う組織を設立していた。その目的は悪石によって殺された両親の復讐と、石へと変えられてしまった姉アオイを元に戻すためだった。所長・研美悠士と共に悪石と戦い続けていた。アルマを見る周囲の目も変わり始めた頃、研究所から逃亡し、研美を執拗に狙う輝島ナイトとフェイがアルマ達の前に現れる。初めは敵として戦うが、ナイとは研美達がセイクリッドテイカーで人体実験を行っており、フェイの兄をも殺害していた事を告げる。その時、暴走する悪石と化して生き延びていたフェイの兄「0号」が、アルマやナイト達に襲い掛かる。研美と共に0号を退けたアルマ達であったが、それもすべて研美が仕組んでいたことだった。研美の目的はセイクリッドの力の独占であり、これまでの事件はアルマの能力を高めるため仕組まれたものだった。彼は人体実験を咎め出資を断ったルリの両親をも悪石を操って殺害していた。ルリは研美の巧妙な罠にはまり、藍羽財団は脱税と横領の嫌疑を掛けられ活動休止を余儀なくされ、ルリは姉のアオイと共に研美に拉致されてしまう。鏡は独自にルリを奪還する為、自らの意志で集ったアルマやメイド隊、そしてフェイを伴い、先行するナイトを追って研美研究所を襲う。研美は0号の体内から奪ったコアを自らの体内に取り込み、セイクリッドセブンの力を得た怪物へと変身した。研美はナイトやフェイの力を吸収しさらに強大になっていくが、ルリと想いを通わせパワーアップしたアルマによって倒される。研美は最後のあがきとしてフェイにコアを埋め込み、世界を破滅させようと目論むが、眠りから目覚めたアオイがナイトをパワーアップさせる。ナイトはアルマと協力してフェイの救出に成功し、研美の野望は潰えた。自由を手にしたナイトとフェイは再び旅に出、アルマはルリ、鏡、アオイ、鉱石部の友人達と共に日常へと戻っていった。逆アクセスランキングパーツを表示するにはJavaScriptを有効にして下さい。