検体採取具は、プラスチックと紙でできたシンプルなものです。封筒は、返送時に検体採取具を入れるためのものです。検体採取具をズラして、紙製の部分を露出させます。左ほほ、右ほほそれぞれの内側を、1つずつの採取具で8回こすります。2つの採取具を封筒にいれます。最後に、返送用あて先シールを箱に貼り、ガムテープで箱を密封します。Navigenicsに比べるとシンプル。Navigenicsとは違って、検体をdeCODEmeへ送るための送料を負担する必要があります。送料を安くするため、今回は、郵便局で「小形包装物」として発送しました。海外に物品を郵便として発送する際には、「税関告知書(CN22)」というものを出す必要があります。KIT」と書きました。郵便局で発送の際、CN22をチェックされました。窓口の方いわく、これでは内容が分からなく、税関で止められる場合もある、とのこと。Paper」とか、とにかく「安全なものである」ということを書いたほうがよい、とアドバイスを受けました。よって、CN22にそれらの文言を書き加え、発送しました。2010/05/23に検体を送りました。2010/05/26に検体が到着したとのメールが到着。2010/06/16に検査結果が出たとのメールが到着しました。deCODEmeのサイトを閲覧しましょう。自分の個人情報を設定します。Gender(性別)とEthnicity(民族性)は必須入力項目です。deCODEmeに通知した個人情報は、項目ごとに公開の範囲を選択することができます。friendsにのみ公開、まったく公開しない、の3種類の公開範囲を選択できます。Resultsという2つの結果を知ることができます。Resultsでは自分の先祖がどのような系統であるのかという情報を知ることができます。Resultsを見てみます。結果ページには、ずらっと検査項目が並んでいます。ABO血液型についての結果を閲覧してみましょう。deCODEmeでは結果を見るためには、項目ごとにいくつかの手順を踏む必要があります。項目をクリックすると、「本当に結果を表示していいのかどうか」を確認する画面が表示されます。次に、簡単なアンケート画面が表示されます。アンケートの質問としては、自分や自分の親が特定の疾患であると診断されたことがあるか?というものがメインです。これらの回答についても、情報公開する範囲を選択することができます。アンケートに答えると、診断結果のサマリーが選択した項目に表示されます。results」のリンクをたどると、詳細な結果を閲覧することができます。Nagigenicsに比べ、画像や写真を使って見た目がキレイですね。診断結果の根拠となる論文等へのリンクもあります。診断に使われたSNP近辺を、Javaで動作するゲノムブラウザで閲覧することもできます。すべての検査結果を閲覧するためには、検査項目ごとに上記の操作を繰り返していきます。地味に大変な作業です。上記の捜査を行ったのに、結果が表示されない項目があります。実は、Ethnicity/Genderによっては、いくつかの検査項目について結果が表示されません。東アジア人男性は根拠となるデータが少なく、妥当性のある結果が出せないのでしょう。あーせっかく一番高いコースにしたのにっ!冷静になって考えれば、根拠が薄いデータを出されるよりは「わかんねー」と正直に言ってもらえるほうがいいですよね。好感度が上がりました。同時に、ちょっと損した気分になったけど。解析されたデータは、deCODEme側に保持されています。将来的に新たなエビデンスが発見されれば、結果が閲覧できるようになるようです。deCODEmeの結果と、他サービスとの結果が異なることもあるようです。ABO血液型については、23andMeとdeCODEmeで結果が違う場合があるようです。検査しているSNP(s)が違うから、というのが理由らしいです。結局、どんな検査結果を閲覧することができるんでしょうか。東アジア人男性が閲覧できる検査結果一覧は、以下のとおりです。Metabolism(ワルファリン代謝)東アジア人男性ではNavigenicsのほうが閲覧できる検査結果が多いようです。結果をざっと見る限り、株式会社wktk代表取締役は、肺が弱くて、自己免疫疾患もかかりやすめ、といったところでしょうか。疾病に対するものではない検査項目がNavigenicsより多いです。見ていて楽しいですね。ニコチン依存性なども分かります。Resultsを見てみます。Resultsの中にはいくつかのメニューがあります。originsという項目を見ます。22個の常染色体と、X染色体について、europian/african/east-asianの3グループのうちどれに一番マッチするか、というのをコンピュータで検査した結果です。X染色体のほうは、6%もeuropianが入っているようです。いえ、このデータがどういう意味を持つのか、というのがよく分かりません。lineという項目を見ます。これは、母由来のミトコンドリアDNAを解析した結果です。いわゆるミトコンドリア・イブから、どのように分化していったのかを示す表があります。自分のミトコンドリアDNAがどのグループに属するかが、表上に図示されています。Dに属するらしいです。当該mitogroupについて、簡単な説明とWikipedia英語版記事へのリンクがあります。同じmitogroupの人を閲覧することもでいます。マイミクならぬ、マイミト。同じmitogroupのdeCODEmeユーザに対してメッセージを送ることができたりします。どんなメッセージがやりとりされているんでしょうか。Dだから仲良くしようぜ!」とかかな。lineという項目を見ます。これは、父由来のY染色体を解析した結果です。ミトコンドリアDNAの図と似ています。Y染色体グループにはさらにサブグループがあります。僕の場合は、Y染色体グループがOで、サブグループはO3a3でした。日本人男性の半数はOグループなんだって。これらの結果を見る限り、僕は東アジア人のようです。イタリア生まれ長崎育ちの色男だと思っていたのになー...もっといろいろ混血していれば、面白い結果が出るのかもしれないですね。kinshipという項目を見ます。kinshipを閲覧する際には、Javaのアプリケーションが起動します。いくつかの軸のなかから3軸を選び、地域ごとに色分けされた遺伝情報を3次元上に描くものです。東アジア人ゾーンにプロットされていました。ちぇ...(ゲバラ)SNPsのcsvデータdeCODEmeでは、解析されたSNPsの一覧をcsvファイルでダウンロードすることができます。いうわけで、ダウンロードした僕のSNPsデータを公開します。ファイル形式はcsvファイルです。SNPごとに、自分がどのタイプであるのかがわかります。「P2Pで公開されることにより、クラウド上で永遠と複製され続けるDNA」的なストーリーで、メディアアートなどに仕立ててやってください。「子孫から訴えられたりするので、公開やめたほうがいいよ!」とありがたいアドバイスもいただいたのですが、ためしに公開してみます。csvファイルを開いたエディタは、EmEditorです。EmEditorはWindows用のエディタです。csv/tsvファイルを整形して表示し、編集できる機能があって便利です。メモリには乗りきらない巨大なテキストファイルの一部のみを開く機能もあります。巨大なcsvファイルを閲覧・編集するのにうってつけですね。Codingも使えます。両サービスのよいところ、悪いところをまとめました。Navigenicsのよいところ東アジア人男性でも、多くの検査結果を知ることができる。deCODEmeのよいところ苦味受容や目の色など、疾病ではない項目の検査結果を知ることができる。将来的に、Navigenicsより多くの結果を知りうる可能性がある。祖先の情報を知ることができる。SNPsの情報をcsvデータで得ることができる。検査結果が見た目がキレイで、楽しい。Navigenicsの悪いところ検体取得作業が手間がかかる。FedExで検体を送付するのにひと手間かかる。検査結果の妥当性については、deCODEmeよりは低い可能性がある。deCODEmeの悪いところ現時点では、東アジア人男性が閲覧できる検査項目が少ない。心臓病コース・がんコースでは、ほとんどの結果が表示されないと予想される。どちらのサービスも、知りたくない検査結果を知らないで済むように注意深く作られているところがよいと感じました。あたりまえかもしれないけど。まとめNavigenicsとdeCODEmeという2大遺伝子検査サービスについて実際に検査を申し込んでみました。どのように検体を取るのか、検査結果はどのように表示されるのかについて写真・画像を使って概説させていただきました。現段階では、東アジア人がこのような遺伝子検査サービスを申し込んでも、値段が高いわりには得られる情報の質が高くないという印象です。「高額な占い」気分で検査するのがよいと考えます。ALDH2や肥満などの検査であれば、日本でも検査キットが簡単に入手できます。特定の遺伝情報について知りたいのであれば、そういったキットで充分ではないでしょうか。日本人に特化していて、気軽に申し込め、多くのSNPを検査できるサービスが望まれます。ちなみに、NagivenicsとdeCODEmeのアフィリエイト収入でウハウハ計画を夢見ていたのですが、両社ともアフィリエイトが無かったのです。ØMQ(zeromq)について調査する。グニャラくん株式会社wktkという会社を趣味で経営しているWeb系ITエンジニアです。@tasukuchan。