deCODEmeとNavigenicsで遺伝子検査をしたデータを公開してみる。グニャラくんの株式会社wktk運営日記deCODEmeとNavigenicsで遺伝子検査をしたデータを公開してみる。Tweet弊社、株式会社wktkは代表取締役一人だけが従事する会社です。彼に健康上の問題があれば、ゴーイングコンサーンが崩れてしまいます。遺伝子検査を行うことによって!(キリッというわけで、海外の遺伝子検査サービスを複数申し込んでみて、その比較をしてみました。検査キットや検査結果などの画像が多いので、気楽に流し見てください。本エントリの情報は2010/08/14現在のもので、文中の$はUS$です。Genomicsの4つが挙げられます。これらのサービスでは、遺伝子の検査(特定の疾患にかかるリスクや、薬剤の効き、祖先の情報)をメインのサービスとしています。それ以外にも、遺伝子でつながるSNS的なサービスもやっていたりするものもあります。無料ゲームならぬ、遺伝子でつながるSNSですよ!!!遺伝子出会い系サービスなんか面白そうですね。これらの検査サービスは何が違うのでしょうか。competitorsというページがあります。Genomic以外の3サービスについて言及されています。各サービスで検査される「SNP」と呼ばれるものの数を比較しているようです。Polymorphismの略で、一塩基多型というらしいです。ある塩基配列のうち、1つの塩基のみ異なるやつらの集合、ということのようです。詳細はWikipediaの「一塩基多型」の項目をご覧ください。人間であれば遺伝子のほとんどは共通です。そのうち個人差が出る部分だけを調べてやろう、ということですね。SNPを調べることによって、さまざまな診断を行うわけです。上記比較サイトを見ると、検査されるSNPの数はdeCODEmeが一番多いようです。サービス全体の使い心地は、試してみなきゃわからないですよね。いうわけで、NavigenicsとdeCODEmeの両社で遺伝子検査を申し込んでみました。23andMeは、残念ながら日本から申し込みを行うことができません。Genomicsについては、申し込みを行った方のブログがありますので、そちらを参照ください。NavigenicsNavigenicsのサイトで、アカウントを登録したあとに申し込みを行います。2010/05/13に申し込みを行いました。2010/05/14に、検査キットを発送したよ!というメールが来ました。申し込み後1週間くらいしたら、西濃運輸の人がFedExの包みを持ってきました。包みを開けると、青い箱と、紙袋が出てきました。紙袋を開けると、医療用のFedEx袋やら、FedExの伝票やらが入っています。FedExによる返送料はキット代金に含まれているようです。青い箱を開けてみましょう。説明書と検査キットが出てきました。説明書には、「唾液とれ!袋入れろ!送れ!」って書いてあるようです。検査キットはこんな感じ。「みそぎ」のつもりで、検体を採取する前に、リステリンを使ってしまった馬鹿な僕。何か食べたり飲んだりしたあとは、1時間の間隔を空ける必要があるようです。1時間じっと待ち、唾液をキット内に入れました。規定量まで入れるのがツラかったです...キット内の試験管部分だけを取り外し、フタをして標本袋に入れます。その標本袋を青い箱に入れて、付属のシールでフタをします。その青い箱を医療用のFedEx袋に入れます。FedExの伝票を書きます。伝票の左下に品目が書いてあるのですが、そこにNON-INFECTIOUS/NON-HAZARDOUSって書いてあります。$5の価値があるキレイな俺の唾液!税関申告用の書類を書かなければいけません。送るものの重さを書く欄がありますが、僕が計ったときには116gでした。FedExの伝票と税関申告用の書類をまとめて、粘着面つきの袋に入れます。袋だらけ...検体が入ったキットと各種書類を、近所のFedEx/kinkosに持ち込みました。ここで1つトラブルが発生。なんと、もともと入っていた伝票は無効とのこと。伝票は新しく発行され、全ての内容を書き写す必要がありました。別途料金はかかりませんでしたが、かなり面倒でした。日本のFedExでは使えない伝票だったのかもしれないですね。伝票では、宛先欄に会社名(Navigenics)は記載してありましたが、受取人の氏名欄は空欄のままでした。FedEx/kinkosの窓口の方いわく、受取人の氏名が必要だとのこと。税関用の書類に、Navigenics社の担当者名が書いてあったので、それを書き写しました。2010/05/23に検体を送り、2010/05/28に検体が届いた旨のメールが届きました。2010/06/08に検査結果が出たとのメールが!早速Navigenicsのサイトを見てみます。resultsというページで、どの検査項目について結果を表示するかを選択します。僕は全ての検査項目について検査結果を表示するように設定してみました。Conditions検査結果ページは、検査項目ごとに枠が表示され、罹患するリスクなどの情報が枠内に記載されています。罹患リスクが平均より20%高いか、絶対値として25%以上である枠は、背景色がオレンジ色になります。検査結果の英語が分かんねー...訳してみました。リスクが平均より高いようです。乳糖不耐症である可能性が高いことが分かりました。牛乳でお腹ゴロゴロする人ってことです。したことないんですよねー...検査項目をクリックすると、より詳細な情報が表示されます。Obesity(肥満)について表示してみました。79%の人は、遺伝子的には僕より肥満になりやすいようです。同じページの記述によれば、33%は環境によって影響されるらしいです。DNAというタブがあります。「DNAの特定部位がどのようなパターンである、だから、このくらいのリスクがあるよ。その根拠はこの論文だよ。」といった内容が書いてあります。MedicationsMedicationsというタブがあります。そこでは、ある特定の薬で副作用があるのか、また薬効があるのか、という情報を得ることができます。抗凝固剤ワルファリンは特別な処方が必要で、経口抗血小板薬クロピドグレルは薬効が減っていくのであんまり効かないようです。Scan)$2,000の3コースを選択できます。がん&心臓病コースは、$200割引で$800です。今回は、$2,000の全部入りコースを2010/05/13に申し込みました。2010/05/14に、検査キットを発送したよ!というメールが来ました。それから1週間後くらいすると、事務所ポストに白い封筒が突っ込んでありました。封筒の端っこは破けています。封筒を開けると、キットが出てきました。キットの箱は返送時にも使うため、丁寧に扱う必要があります。