ドキュメントルートとして/usr/local/wiki/SiteA/usr/local/wiki/SiteB/usr/local/wiki/SiteCという具合でPukiwikiをインストールしました。ドキュメントルート直下にPukiwikiをインストールした場合は問題ないのですが、間に1つディレクトリーが入ると見れなくなってしまいます。13:05:02ディレクトリに対してアクセス権がありませんというエラーメッセージなので、Webサーバの設定の問題、あるいは、作ったディレクトリに対する権限の問題だと思います。16:38:34/usr/local/wikiの本体は別のNFSサーバーだったのですが、ローカルにしたら直りました。