と他のタンパク質を分ける軸と解釈できます。同義コドン使用は、生物間やゲノム内の遺伝子間で違いが認められ、複合的な要因(G+C含量、複製鎖間の違い、遺伝子発現量の違い)を反映します。遺伝子のコドン使用の情報は、水平伝播遺伝子や遺伝子発現量を予測するのにも利用できます。コドン使用の情報は、水平伝播遺伝子や遺伝子発現量の予測に利用されています。コドン使用は以下のように様々な形で表現することができます。コドン使用データは以下のように様々な形で表現されます。いわゆる、計数値、カウント。いわゆる、計数値、カウント。全ての値を合計すると1になる。全ての値を合計すると1になる。各アミノ酸における合計値が1になる。各アミノ酸における合計値が1になる。各アミノ酸における合計値がコドン縮重度(2,​3,​4,​6)になる。各アミノ酸における合計値がコドン縮重度(2,​3,​4,​6)になる。Pheは2、Ileは3、Valは4、Leuは6。各コドンの度数を各アミノ酸における最大度数により除す正規化。各コドンの度数を各アミノ酸における最大度数により除す正規化。おける全遺伝子群の累積コドン使用をR0〜R4でグラフ出力するには以下のように入力します。おける全遺伝子群の累積コドン使用をR0〜R4でグラフ出力するには以下のように入力します。