佐渡航路で競合していた商船会社3社を経営安定の見地から新潟県の資本参画のもと統合して成立した。当初から半官半民で設立された日本最初の第三セクター企業である。現在も新潟県が資本金の39.2%を出資している。と1隻の高速船を就航させている。佐渡汽船グループの収入は佐渡島への観光客に依存する割合が非常に高く、観光客数の変動は損益に大きな影響を与えている。悪影響を及ぼす可能性がある。2金利の変動による影響について佐渡汽船グループは事業計画に基づき継続的に船舶等の設備投資を行っている。この資金は主に金融機関からの借入れによる。佐渡汽船グループは有利子負債の削減に努めているが、変動金利で調達している資金については金利変動の影響を受ける。将来の資金調達コストに悪影響を及ぼす可能性がある。3減損会計導入による影響について企業会計審議会から「固定資産の減損に係る会計基準」が公表されており、佐渡汽船グループは原則適用により平成18年度よりこの会計基準を適用する。悪影響を及ぼす可能性がある。