Abstract形態と遺伝子のデータに基づいて、日本列島住民の身体形質が、更新世から縄文〜弥生移行期まで、いかに変化したかを明らかにし、新たな日本人形成過程のシナリオを構築する。これが本研究の最終目的であるが、第2年度の平成18年度には、以下のような調査・分析を行なった。ハナンダー洞穴を発掘し、2〜3万年前に絶滅したリュウキュウシカなどの獣骨化石数百点とヒトの膝蓋骨1個を発見した。同遺跡出土シカ化石との相対年代の判定も行なった。共通な特徴を抽出した。三次元マイクロCT解析により港川人1号の脳容量が従来の推定値よりも相当小さいことも明らかにした。ついても整理・分析した。同じ母系を持つ可能性を指摘した。弥生時代の枠組み変化による日本人起源仮説への影響の検討:弥生時代の人口増加を発掘住居数を用いて解析する数理的方法を検討した。ため、コラーゲン精製法や海洋リザーバー年代補正法の検討を行なった。地理的変異パターンにおける時代間差の分析:縄文・古墳時代の頭蓋計測値の地理的変異パターンの比較から、地域ごとに異なる時代的変化か、大きな移住の流れがあったことが示唆された。