NCBI(アメリカ)、EBI(ヨーロッパ)、DDBJ(日本)の3つでデータ交換をしている。TypeをStudyで絞り込み。)からの絞り込みが可能。http://p.ddbj.nig.ac.jp/実際の解析1:クオリティチェック・トリミングクオリティチェックには主にFASTQCというツールが使われます。FASTAフォーマット場合によっては(NCBIからダウンロードしたときなど)サイズ削減などのため、sra形式で圧縮されている場合があります。DRR1234567.trimmed.fasta結果:sam/bamフォーマットコマンド例:形式変換マッピングはsam形式かbam形式で出力されますsamは人間が読めるがサイズが大きいです。クラスタとしてまとまったもの。基本的にはmappingと同様。1塩基のずれも重要なので(場合によってはmappingでのツールで大雑把にアラインメントをとった後)精度重視でのmappingを行う。その後、variantの解析を行う。ライセンスの下で利用可能です。利用にあたっては、下記のクレジットを必ず表示してください。(CC-BY-4.0)。