先行研究で指摘されるように(http://​nar.oxfordjournals.org/​cgi/​content/​full/​33/​4/​1141/​FIG4)、rRNA遺伝子数とtRNA遺伝子数に強い正の相関があることがわかります(rRNA-tRNAのプロットが相関係数r=0.9を示している)。同様に、別の先行研究で指摘されていますように(http://​www.pnas.org/​content/​101/​9/​3160/​F2.expansion.html)、CDS数とゲノムサイズにも強い正の相関が見られます(cds-sizeのプロットが相関係数r=1を示している)。(rRNA-tRNAのプロットが相関係数r=0.9を示している)。同様に、別の先行研究で指摘されていますように(http://​www.pnas.org/​content/​101/​9/​3160/​F2.expansion.html)、CDS数とゲノムサイズにも強い正の相関が見られます(cds-sizeのプロットが相関係数r=1を示している)。genitalium)の遺伝子についてさまざまな統計的な解析をおこなったものです。http://​www.ncbi.nlm.nih.gov/​pubmed/​3547335)、同義コドンの均一性を示す重み付けされた相対エントロピーの和(http://​www.ncbi.nlm.nih.gov/​pubmed/​15194186)が含まれます。このスクリプトを実行すると以下のようなタブ区切りの結果が'​stat.txt'​として保存されます。4で示したようにRコマンドを書き加えることで描画されます。このスクリプトを実行すると'​Rplot.ps'​というファイルが出力されます。図のstart-gcc3プロットより、マイコプラズマ菌のGC組成は特徴的な傾向を示していることが分かります。gcc3-caiとgcc3-Ewプロっトより、GC組成とコドン使用頻度の偏りに相関があることが分かります。これらは先行研究の知見とも一致します(http://​www.horizonpress.com/​cimb/​v/​v3/​v3n403.pdf・図2)。skewとコドン使用頻度の偏りに相関が見られます。