言ってみたりスマートフォン用の表示で見るとか言ってみたりこの広告は、90日以上更新していないブログに表示しています。18:58おかねTweet広告を非表示にするもっと読むコメントを書く2014-10-29秋晴れ、そして先週の金曜日から東京は好天に恵まれ、一気に秋らしくなってきた。今に始まったことではないけど天気と気分が正比例するタイプの人間である僕の脳みそも、この4日間は静かな高揚感に包まれている。先週金曜日は3ヶ月ぶりの実験進捗プレゼンで、雨天だった前日までは挙動不審な解析ソフトに悩まされて死にたくなっていたのに、いざ蓋を開けてみるとそれなりに体裁を整えた発表が完成して、ラボのメンバーからも有用なアドバイスがもらえて大いに生きる希望が湧いてきた。前日までの憂鬱さが嘘のように思えた。日曜日は母校ICUの学園祭で、これが毎年まったく見どころがなく寂れた高校の文化祭のような学園祭なのだけど、いざ卒業してみると懐かしく思うもので昼過ぎにノコノコ行って茄子田楽を齧りながら後輩にちょっかいを出し、ラボに顔を出して旧交を温めたりした。月曜日からはDNAワークのペースを上げてプラスミドコンストの完成を急いでいる。やった時はあんなに嫌だったシーケンス用プライマーの設計も、二度目になるとものの20分で終えてしまった。作業の続きが経験されていると、その途中段階をいちいち意識しなくなるのかもしれない。今年も終わりに近づき、ふとしたときに一年の行いについて思い返すことが増えてきた。あと二ヶ月、楽しく生きたい。来週からの台湾出張が楽しみである。14:20秋晴れ、そしてTweet広告を非表示にするもっと読むコメントを書く2014-09-24プライマー設計嫌すぎまあタイトルの通りなのだけど。DNAワークに従事する実験生物学者は、プライマーの設計という作業をルーチン的に行っている。自分が設計した遺伝子発現ベクターがうまく作れたか確認するため、あるいは遺伝子配列をシーケンサーで読むためなど、用途はいろいろで、必然的に扱う回数は頻繁になる。そのプライマー設計がものすごく退屈なのである。目標配列を工夫して継ぎ接ぎするPCRプライマーならまだしも、目標配列を決まった間隔で決まった長さだけとってくるシーケンサー用プライマーなどは、単純作業なのに数が多いのでほんとに脳死しそうである。Webサーバー構築がはかどるばかりである。Sprint記事のまとめをしたいと思う。API実装が完了してしまい、塾業務や大学院のレポートなどハッカソンとは関係のない業務に追われていた*1。それも若干飽きてきた夕方頃にすこしGUI周りを整備して、とりあえず今回のプロジェクトを完成とすることにした。最終日は午前中に成果報告プレゼンのスライド作り、昼食後は全員が4分以内の成果報告、そして江ノ電長谷駅まで移動してオイスターバー「COCOMO」で打ち上げ、と楽しく過ごした。成果発表会では参加者がそれぞれ3日でできたとは思えない華々しい成果を発表していて、聞いていて大変刺激になった。プレゼン中のデモは必ずまごつくという法則も実証されたので、みなさんスクリーンキャプチャしましょう。今年はオブジェクト指向プログラミングとGUI作成という初挑戦を2つも盛り込んだプロジェクト計画を出してしまったので、2日目の頭には「やりすぎたな」と弱気になったりしたものの、最終的には予定を大幅に繰り上げて目標が達成できたので心理的に大変プラスになった。一人で何となくコード書いている時とプログラムを書くという目標が共有された空間で書くのとでは楽しさがぜんぜん違う。来年以降も、日本にいる限りは参加したい、素晴らしいハッカソンであった。2014中盤ですSprint中盤にさしかかった今日は、ガジェットのGUI部分を作って既存のPythonスクリプトと統合することを目標に格闘していた。最初はwxPythonでやっていたのだけど、文法が煩雑なのとリファレンスが少ないのとで昼過ぎに音を上げ、PyQtに引っ越すことを決めて途中経過のコードを爆破した。PyQtがわかりやすかったおかげで、インストールから2時間ほどでおおまかな外枠を作れたのは嬉しい誤算だった。その後本格的にスクリプト移植を進め、22時過ぎに最後のバグを潰して、とりあえず元のスクリプトがやっていた作業を再現することに成功し、今日の目標を達成した。APIの実装に着手する予定である。Sprint」に参加している。コードをひたすら書く合宿で、僕はバイト先で書いているコードをGarudaガジェット化することにした。したわけで少しフォーマルなPythonコードを書くことになり、いままで避けてしまっていたオブジェクト指向(クラスとか__init__とか)、wxpythonを使ったGUIプログラミングを必死に自習している。クラスの宣言とかそのへんを練習していたらお酒が飲みたくなってきた。昨日ラボに行ってみたら妙に暑いので様子を聞いてみたら、エアコンの室外機が故障してしまったという。尋常じゃない暑さなのでとても実験もデスクワークもできず、今日は図書館にこもっている。進学後最初の学期が終わり、山のような読書課題と沼のようなレポートから(ほぼ)解放された。第2外国語である中国語もちょっとわかるようになった。インターン先の研究プロジェクトが一段落したので短い論文を書いている。学期中にレポートがたくさんありすぎたせいか食傷気味であまり筆が進まない。履歴書を賑わすために踏ん張らねば。いえば、昨日はラボにカリフォルニアからかなり有名な先生が遊びに来て、セミナーと食事会で大いに盛り上がった。同じ疑問を共有していることがわかってから、一緒に実験案を考えて「じゃあ君やりなよ」とボスともども後押しされたのでサイドプロジェクトとして走らせてみようと思う。来月は最初一週間京都へ研修合宿にいって、その後は念願の実験三昧。9月まで夏休みという経験が生まれて初めてなので少し調子が狂うが、嬉しい*1。今シーズンはFree!と東京喰種とばらかもんを観ている。どれも違うベクトルで面白い。一昨日観に行った劇場版Kとグランドブダペストホテルも両方素晴らしい映画だった。最近飲んだ日本酒の中では、風の森秋津穂間中絞りと刈穂純米吟醸六舟が美味しかった。どちらも夏にピッタリの爽やかさ。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。