理由はいまいちよくわかりません。管理するファイルダウンロードを同時にやると不具合が多い(ように感じる)ので、これを分離して行います。git-lfs/git-lfs流れとしては下記の通りです。管理のバイナリファイルのダウンロードのことだと思えばよいです。何度実行しても支障ないようです。ダウンロードされますので、非常に高速にリポジトリが同期されます。叩くと実ファイルがダウンロードされます。これは当たり前ですが、ファイルの容量に応じてけっこう時間がかかります。設定を戻しておきます。実行して上記の手順に従えば失敗の可能性は低くなると思います。不満を感じていらっしゃることでしょう(笑)まだ発展途上な部分も多いと思うので、これから改善されていくといいのですが...。SourceTreeSNSでもご購読できます。