updateLAMMPSの実行と解析に必要なパッケージをインストールします。ダウンロードと展開にしばらくかかります。xkb-dataaptコマンド等のコマンドの使い方は、Debianのパッケージ管理を参照してください。X-windowWindows用のX-windowとしてVcXsrvをインストールします。クリックしてX-windowを起動します。MacOSはX-windowをインストールする必要はありません。ます(学内からのみアクセスできます)。5分くらいかかります。~/Windows+WSLの人はmpirunを実行するとエラーが表示されるのでおまじないを唱える。/proc/sys/kernel/yama/ptrace_scopedotファイルをインストールします。自前のファイルがある場合は退避させて自分でmergeしてください。~/dotファイルをインストールします。自前のファイルがある場合は退避させて自分でmergeしてください。$HOME/pyに展開しますので、適当にパスを通してください。~/実行テスト上手くインストールできているか確認するために、LAMMPSを実行してみます。インプットファイルをダウンロードして2コアで並列計算してみます。NaCl.in計算結果が表示されれば、インストールは完了しています。きると画面に計算経過が表示されます。計算が完了したらログファイルをプロットします。LinuxではX-windowが起動していなとプロット画面が表示されません。log.lammpsプロットした結果が表示されれば問題なく全てインストールされています。外してX-windowを起動します。vmdで可視化してみます。うまく実行されると計算結果が可視化できます。NaCl.lammpstrjVMD計算結果を可視化するためにVMDをインストールします。OSにあったファイルをダウンロードします。Usernameの登録が求められるので指示に従います。https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/Python自前でPython3.7をインストールする場合は、以下のモジュールが必要です。miniconda等を使ってインストールします。するためにVESTAをインストールします。