2008年も順調に勝利数を重ねた。(洋一は5086戦目で983勝目をあげている)[30]。11月30日京都競馬場で行われた12Rでオリオンスターズに騎乗し中央競馬史上23人目となるJRA通算1000勝を達成した[31]。負傷した武豊騎手に代わっての出場[32]。順調な勝利とは裏腹にこの年はGI競走での勝利がなく、連続勝利記録は7年で途絶えた。2007年の優駿牝馬以来、GI競走での勝利から遠ざかっていたが、2010年の阪神ジュベナイルフィリーズで1番人気に支持されたレーヴディソールに騎乗し勝利[33]。2011年、札幌記念などサマーシリーズの3レースを勝ち、サマージョッキーズシリーズを2位に15ポイント差で優勝[34]。ブエナビスタの妹ジョワドヴィーヴルにて阪神ジュベナイルフィリーズを連覇[35]。岩田康誠との熾烈なリーディングジョッキー争いを制し、16年目で全国リーディングジョッキーとなると同時に、JRA史上初の親子での達成となった[36]。勝利を含めた勝利数で上回った岩田が受賞し、福永はJRA賞最高勝率騎手を受賞した[37]。2012年、6月2日の鳴尾記念をトゥザグローリーで勝利、さらに翌日の安田記念をストロングリターンで勝利し2005年以来の牡馬牝馬混合GIを制覇。その勢いを持って同日に行われたユニコーンステークスもストローハットで勝利し史上初の同一週3重賞勝利を達成[38]。宝塚記念後、8月末までアメリカへ遠征する[39]。札幌記念でダークシャドウに騎乗するため、一時帰国した[40]。2013年3月、松尾翠(元フジテレビアナウンサー)と結婚、8月20日に婚姻届を提出した。松尾幸弘陸将(現・東芝顧問)は義父にあたる。同年10月6日、毎日王冠でJRA重賞100勝を達成[41]。10月20日、菊花賞で牡馬クラシック初制覇と同時に、父・洋一との親子制覇を達成した[42]。10月27日、天皇賞(秋)を制覇し、2週連続で八大競走親子制覇を達成した[43]。菊花賞と天皇賞(秋)を同一年に連覇したのは1965年の栗田勝以来である。最終的に131勝を挙げ2011年以来となるリーディングジョッキーとなった[44]。この年から始まった初代MVJに選ばれた[4]ほか、中京開催で20勝し、中京開催リーディングジョッキーになった[45]。2014年、3月29日のドバイデューティーフリーをジャスタウェイで勝利[46]。この年は118勝を挙げるが、全国リーディング4位となった[47]。中京開催で19勝し、2年連続中京開催リーディングジョッキーになった[48]。2015年は、121勝を挙げリーディング1位を走っていたが[49]、10月31日のスワンステークスにて、最後の直線でテイエムタイホーが斜行、接触し落馬した[50]。明らかになった[51]。怪我後2016年は2月13日の京都競馬で復帰し、7鞍に騎乗するも、勝利にはならなかった[52]が、翌日の14日に復帰後初勝利を挙げた[53]。2016年10月16日に行われた秋華賞をヴィブロスで優勝し、G1レース通算20勝目をマークした[54]。2017年7月15日、武豊に次ぐ2番目のスピードでJRA通算2,000勝を達成[55]。第85回日本ダービー表彰式(中央が福永祐一)2018年5月27日に行われた第85回東京優駿(日本ダービー)を5番人気ワグネリアンで優勝。19回目にして初の日本ダービー制覇を達成した[56]。父が成し遂げられなかった福永家悲願のダービー制覇となった。2019年3月24日、中京競馬場にて開催された第49回高松宮記念をミスターメロディで勝利[57]。レース5日前の3月19日にはキングヘイローが他界しており、かつてのパートナーに捧げる勝利となった[58]。現在は競馬学校花の12期生の1人として語られることも多いが、その前年に競馬学校11期生の入学試験を受けている。直前に負った足の骨折で体力試験をパスできずに不合格。通い[59]、翌年に再受験し合格したため、1歳年上の細江純子以外の同期生は福永より1歳年下である。プレイすることが多いという。『ジーワンジョッキー』ではゲーム中に自分自身が実名で登場するため、自分の名前ではなくエディット機能を使用して父・洋一の名前でプレイしている[60]。競馬場の風来坊2』)において、福永は武豊や横山典弘と比較すると、騎手としての素質をさほど持ち合わせていないと評している[80]。柔らかくしようとしているけど、下半身が固いから、努力だけで終わってる」と指摘している[80]。田原は、この著書を出版した1997年頃から福永の自宅へ出向き、細かい扶助から馬の動かし方まで、マンツーマンでいろいろと指導を行っていた[81][82]。福永曰く「研修生」のような状態であり、1998年皐月賞レース直後には「下手くそ!」「お前、今日のレースは勝ってたぞ」と調整ルームにて酷評されている。安田助手がインタビューで言及している[84][85]。JRA所属騎手の小牧太は、「(福永を)すごく応援してる。人間性がね、すごく好きやねん。この人が上に立って、引っ張っていってくれたらいいなぁって思う。彼はそれくらいの精神力を持っている気がするから。」「(福永は)よう考えてる、いろいろね。アメリカに行って、乗り方もレベルアップしたと思うよ。」[86]「彼はとにかく賢いし、黙々と頑張ってる感じやね。彼自身で変わったことといえば、結婚していいパパになったことくらいでしょう。騎手クラブの仕事も一生懸命にやってくれて、ホンマに責任感の強い子やね。」[87]と評価している。競馬界の真実』)において、福永の騎乗フォームについて、「おそらく体が硬い」ことが原因で騎乗時に馬と体の間にムダな隙間が生じてバランスが非常に悪く、また騎乗技術に長けた騎手に比べ体重が後ろにかかっているため懐が大きく開き、膝でバランスをとろうとして膝がガックンガックン動いてしまっている、と指摘[88]。加えて「勝ちにこだわった騎乗」もできておらず、「強い馬に乗せてもらっているから勝っている」に過ぎない、と評している[89]。福永自身がしばしばJRAの制裁対象となっているにもかかわらず、若手騎手に対しては安全に配慮した騎乗ができていないと調整ルームで「威圧している」とし、批判している[90]。藤田は現役引退後にスタートした自身のオフィシャルサイト内のコラムでは「(福永は)己の技術を知ってるからこそ、今でも先輩らに耳を傾ける人間なんだよ。人格って凄いよな!俺が真似出来たら、まだ現役だよ!」[91]と人格に関しては評価をしており、レース回顧においては福永の騎乗を褒める記述も見られる[92][93]。JRAに所属していた元騎手の坂井千明はブログの中で、2013年菊花賞における福永(エピファネイア騎乗)について、「祐一の抑え方もうまかったよ。手綱を引っ張っていても、拳は上げないで自分の重心を後ろに持っていく感じ。ハミを噛んではいても、頭が上がらないようにうまくバランスを取っていたよ。頭を上げたら馬とケンカになって、抑えが利かなくなっていたと思う。」[94]と評価している。JRA所属騎手の四位洋文は対談において、「デビューした頃の祐一はひどかったもんなぁ(笑)。」[95]としつつも、「祐一は本当に頑張ったよ。今でも本当に頑張っている。祐一は頭がいいから、他のジョッキーに比べて自分をプロデュースする能力に長けているんだと思う。俺に祐一の頭の良さがあったら、もっとすごいジョッキーになれたのになぁ。」「無意識に自分をプロデュースできているんだろうね。誰からも好かれるし、その結果、いい波がどんどんくる。的場文男は対談において、「祐一くんの騎乗フォームなんか、本当にキレイだもんね。道中も直線も本当にキレイに乗ってくる。馬はものすごく楽だと思うよ。」[97]と評価している。東京スポーツ記者虎石晃はコラムの中で、2016年8月28日朱鷺ステークスにおける福永の騎乗について、「最大の衝撃は10Rのペイシャフェリスを1着に導いたこと。これはまさに神がかり。」[98]と評価している。JRA美浦所属の調教師中川公成の「あまりいいこと言わない人が多いけど、福永って上手いと思うんだけどな」との意見に対し、虎石は「G1となると、先週のような消極的な面が出てしまうけれど、平場は、先生が言う通り、上手いですよ。スタートセンスは抜群だし、往々にして勝てる位置で競馬をしてくれますから。」と答えている[99]。競馬場の風来坊2』マガジン・マガジン、1997年。978-4-914967-15-4。2210〉、2013年。978-4-06-288210-1。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2016年4月7日閲覧。2015年6月19日閲覧。2015年11月8日閲覧。2016年7月2日閲覧。2016年4月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。2016年4月19日閲覧。2015年11月8日閲覧。“「また力の限りやってみたい」柴田未崎、36歳の騎手再デビュー。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。“エイシンフラッシュ秋盾連覇が見えた!福永も太鼓判「衰えはない。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2016年2月14日閲覧。2016年2月14日閲覧。2017年7月24日閲覧。2018年5月27日閲覧。2019年3月25日閲覧。2015年1月4日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2015年11月8日閲覧。2016年3月28日閲覧。2015年12月31日閲覧。2014年7月22日閲覧。2015年1月13日閲覧。2014年7月22日閲覧。2012年12月20日閲覧。2016年10月17日閲覧。2012年12月11日閲覧。2016年6月14日閲覧。2016年4月6日閲覧。2016年10月16日閲覧。2016年11月6日閲覧。2013年10月21日閲覧。2015年1月6日閲覧。2015年1月13日閲覧。2016年12月13日閲覧。2016年8月29日閲覧。2011年1月2日より開始。