...メス化と単為生殖2015-04-30ヒートマップ研究RNA-seqのデータをもとに、共同研究者にヒートマップを作っていただいた。Lettersにアクセプトになった論文の内容を簡単に説明しておきます。今まで依頼された査読を引き受けて、返したあと、一応その内容をPCに保存していたが、Publonsという以下のサイトに登録しておくとネット上にその内容を保管しておくことができる。どの雑誌の査読を行ったのかを時系列でみることができる。科研費に受かったという連絡を受けた。分担者として頑張らせていただきます。シンポジウムを開催します。研究ハワイの海に、ミミイカという親指ほどの大きさのイカがいる。この小さなイカの体の底面には、発光器官があってそこから光を発する。この発光器官には共生細菌がぎっしりつまっていて、それが光を発している。今日はカイコの幼虫にいろんな細菌をインジェクションした。2か月ほど前に記者のかたから突然電話がかかってきて、取材を受けたのですが、記事の内容については一切教えてくれず(新聞社のポリシーらしい)、4/3の朝刊に載ることを前日知らされました。昆虫を使った研究をやっているのに、恥ずかしいことに節足動物の基本的な分類を正確に知らなかったのでまとめてみた。希釈して培養してみた。培地にフェノールレッドを入れているので、増殖が進むと黄色に変わる。107希釈あたりが限界のようだ。クローン化できているだろうか。このあと放置しても赤色のウェルは赤色のままだった。本ボルバキア研究の歴史的なことについては、やはりこの本が役に立つ。大学院生のころによく読んでいたので手垢で汚い・・・。今日業者のかたに教えてもらったが、プロメガGoTaqの第2世代であるGoTaqG2が出ているらしい。GoTaqはかなりの安価で増幅感度も良い酵素なので気に入っている。この酵素は他の会社のものと比べてとにかく安くいいのがいい。増幅感度もかなりいい。明日は所内の提案型研究課題の成果報告会などだが、やっと今、一応プレゼンの準備が終わった。今日は新聞社からの取材を受けた。2時間ぐらいいろいろ喋った。内容は、宿主の生殖を操作する共生細菌ボルバキアが宿主の生態や行動や進化にどんな変化を及ぼすのかについて。短い書類だったのでなんとかまとめたが、月末にはプレゼンがあるのでその時までにもっと詳しく解析をしておきたい。今後の進め方も考えておかないといけない。今日締切の査読がやっと終了。すばらしい内容で実験もしっかりしているし、論理構成も完璧でまったく文句なし。雑誌のランクがそれなりに高いとしっかりした内容の原稿が集まりやすいんだろうなあ(当然か・・・)。ちなみに今回は中国からの投稿でした。頼まれていた査読が3本もたまっている。早く終わらせないといけない。研究この週末は岡山大学でのセミナーで3時間話させていただいた。若いエネルギーにさらされて久々にずいぶん刺激を受けた。下手なプレゼンを3時間も熱心に聞いてくれたことに頭が下がる思いだ。注文していた本が今日届いた。2012年に出版された本で、タイトルは日本語にすると「パラサイトによる宿主操作」。知らない話題もたくさん載っているようなので、少しずつ読んでいこうと思う。224ページと、思ったより薄い。Parasites2014-01-09ウイルス研究ダンゴムシのウイルスを感染させた昆虫細胞。ウイルスのせいで細胞が壊れているのかもしれない。CPE)とはウイルスに感染した培養細胞にみられる形態変化のこと。今日の夕方はKさんがダンゴムシを持って来て、前々からこちらで増やしておいたウイルスを注射した。少なくとも前回よりもうまくいった気がする。今日はRNAseqのデータのなかから重要な遺伝子を拾い上げることができた。これはRNAseqのメインの目的ではないのですが、小さな目的が達成できれとりあえず良かった。今日はカイコ卵へのインジェクション。前回のインジェクションで少し面白いことがわかりつつあるので、今回はその追試とさらなる実験を追加する予定。カイコ卵へのインジェクションについては別の研究ユニットに方々に毎回お世話になっています。本当にあり...卵のインジェクション2013-12-25RNAseq研究RNAseqのデータが返ってきた。なんとも言えないけど、大量のデータが手に入ったことは確かだ(笑)。これからバイオインフォマティックス専門のかたに協力してもらいながら解析を進めていく予定。研究ボルバキア感染移植に関する総説が出ていた。した論文の結果が返ってきた。した論文の審査結果が返ってきた。昆虫と微生物の研究者。日々の雑多な記録など。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。