95/98/Meでは、COMMAND.COMという名前の実行ファイルで、Windowsから実行するとCUIが提供されるソフトウェアだった。OSから使用できるCUIウィンドウというものは他のOSでも一般的であるが、DOSプロンプトは従来のコマンドを使用する互換性のためだけに存在するに過ぎず、OSとしての機能がフルで提供されるものではなかった。DOSでは、画面描画はハードウェアを直接アプリケーションが制御していたが、DOSプロンプトはあくまでもOSの環境下である。このようなこともあり、DOSプロンプトでは従来のゲームなどは殆ど動作しなかった。(PC-9800シリーズならA:)が一般的である。プロンプト)と違い、DOSプロンプトの頃はウィンドウサイズは固定で変更できない。機能としても、バックログ機能やヒストリー機能はなく、普通のWindowsアプリケーションとは違いウィンドウ右上の[×]ボタンでは終了できないなど操作感にも大きな差があった。NT系でも、互換性のためか「COMMAND.COM」自体は存在し、使用することができる。