有効期間は5年間で、5年ごとに更新する必要があります。免許の更新手続きは、有効期限の1年前から行うことが出来ます。希望日・時間を相談して講習日程を決めることもできます。希望日・時間を相談して講習日程を決めることもできます。更新手続きを行わず、有効期限が切れてしまった場合は、操縦免許証が失効し、小型船舶に船長として乗船することが出来ません。更新の要件は、身体適性基準を満たしていることと、更新講習機関での講習を修了していることの2つです。身体機能の障害の有無について行われます。眼鏡や補聴器が必要な方は、必ずお持ちください。更新講習は1級・2級、特殊の双方の資格を持っている人は、1回の受講で更新できます。