武器屋か防具屋で何か買おうとすると、城の兵士に捕まってカルナック城に連行される。牢屋に閉じ込められてしばらくするとシドが爆薬を使って牢屋に穴を開けてしまう。シドと話をしていると、カルナックの大臣がやってくる。ここでシドの手助けをするという条件で、バッツたちは牢屋から出ることができる。その後、動力室に向かうことになる。動力室にはリクイドフレイムにあやつられたカルナック女王がいる。女王を止めるためにリクイドフレイムと戦闘することになる。撃破後、クリスタルルームに向かうが結局クリスタルは砕けてしまう。カルナック城爆発までのタイムリミットは10分間。脱出後、新しいジョブを入手する。いなくなったミドを探すために地下に行くことになる。小部屋にある本を調べるとイフリートが出現して戦闘になる。道をふさいでいる本棚は、イフリートを連れてくれば先に進めるようになる。ミドに近づくとビブロスが出現して戦闘になる。酒場にいるシドのもとに向かう。火力船の完成までバッツたちは船室で休むことになる。その後、甲板で寝てるシドに話しかけると火力船が完成している。町に入ると地震が起きて火力船が沈んでしまう。クレセントの町の南にある森に行くと、そこには黒チョコボがいる。黒チョコボを捕まえると乗ることができる。入るとシドとミドが駆け寄ってきて、タイクーン王が見つかったとの知らせが聞ける。その後、タイクーン王を追って流砂の砂漠に向かうことになる。砂漠に足を踏み入れるとシドとミドが後を追ってくる。サンドウォームと戦闘になる。町に入るとここが滅びの町であることがわかる。高台に上ろうとすると画面右下にタイクーン王が現れて消える。王に近づくと、落とし穴に落とされてしまいカタパルトへ移動する。ワープ装置に乗ると三日月島へ移動する。プロペラのついた船に入るとシドとミドが落ちてくる。飛空艇上昇後クレイクロウが出現して戦闘になる。飛空艇で町に近づくと地底から遺跡が浮上する。シドとミドの話によると、アダマンタイトで飛空艇を強化すればもっと高く飛べると言う。ラフが自分の乗ってきた隕石にアダマンタイトがあることを思い出し、取りに行くことになる。隕石の奥にある鉱石を調べるとアダマンタイトを入手できる。帰ろうとするとアダマンタイマイが出現して戦闘になるので注意。部屋で休んでる間に、シドとミドが飛空艇を改造してくれる。飛行中にAボタン(PS版は○ボタン)を押すことで、さらに上空に浮上できるようになる。これでロンカ遺跡に行けるようになる。4ヶ所の砲台を破壊する必要がある。すべて破壊し終わったら中央に巨大な砲台が出現。ソル・カノンを撃破したら遺跡内部に侵入できるようになる。最奥にいるタイクーン王に話しかけた後、アルケオエイビスと戦闘することになる。新ジョブ:侍・竜騎士・踊り子・薬師を入手。机の上を調べるとシドからの手紙が見つかる。隕石に入るとシドとミドがいる。ちなみに3つの隕石はどこから行ってもかまわない。シドかミドに話しかけて2人が戻ってきた直後にピュロボロスが出現して戦闘になる。シドかミドが隕石に入っていくが魔物がいるらしく戻ってくる。巣くってる魔物(タイタン)に話しかけると戦闘になる。倒すと同時に召喚獣『タイタン』を入手する。シドかミドが隕石に入っていくがなかなか戻ってこない。中に入ってみると、巣くってる魔物(キマイラブレイン)に襲われている。魔物に近寄ると戦闘になる。全ての隕石のエネルギーを集めたら、シドが地図でエネルギーの集まる場所を教えてくれる。入ったら戻ってこれないので、やり残したことがある場合は全て済ませておきたい。