観光などを目的に偽造パスポートを使い、1990年代[27][103]から日本に何度か不法入国していた。合法・非合法活動で稼いだ資金の一部が東京で金正男に渡されていたとされる[105]。武器密輸の代金回収が不法来日の目的ではないかとも報じられた[106]。拘束されるという事件が発生した。男は妻子を連れており、ドミニカ共和国の偽造パスポートを使用して、中国語名の『胖熊』[5]という偽名で日本入国を図ったところを、入管難民法違反で拘束・収容され、その際に背中に虎の刺青が施されていることが判明。ボーイング747-400型機で中華人民共和国の北京首都国際空港に向けて出国させた。この男について、日本及び北朝鮮政府いずれからも、金本人かどうかの正式な発表はないが、韓国政府筋は「金正男本人」であるとした。この男は、「東京ディズニーランドに行きたかった」と語った。実際、2009年(平成21年)1月24日に北京首都国際空港に現れた金本人が、日本のマスメディアにインタビューを受けた際のやり取りにおいて、2001年に日本に不法入国しようとした理由につき、「日本に興味があったので旅行に行ったが、現在は簡単に行けない。日本はとても清潔で美しい。経済的にも非常に発展している国だと思う。」と答え、日本へ入国した過去があることと、2001年5月に新東京国際空港で拘束された「金正男とみられる男性」が、本人であることを事実上認めている。