スクリプトの呼び出し方法は以下のとおりです。sample_ana_vec.pyダウンロードはこちらCA原子しかないPDBでバックボーンを表示するサンプル現在読み込まれている分子データをもとに、原子とその次の原子の結合を作るCONECTレコードを生成します。ファイルのフォーマットに従います。スクリプトの呼び出し方法は以下のとおりです。filename>仕様手順は以下のとおりです。以降に追加このデータを読み込んでスティック表示にすると、バックボーンスティックのような表示になります。新機能・修正点MolFeatV5.2.1.26の新機能・修正点は以下のとおりです。290、3100を使って対称分子を生成する機能を追加。結合を追加・削除する機能を追加。電子密度マップデータの数値精度を向上。spriteで描画し、表示速度を高速化。pngで高品質イメージ出力を保存する際、背景色を透明にするように変更。分子の重ね合わせをアラインメントに沿って自動的に行うコマンドを追加。結合の多重度を表示するとき芳香環を実線と破線で表示するように変更。低分子化合物の編集機能を追加。分子をmol2形式で書き出す機能を追加。新機能・修正点MolFeatV5.1.1.25の新機能・修正点は以下のとおりです。シーケンスビューをフロート(メインのウィンドウから独立した状態)にした際に、Shiftキー/Ctrl(Mac版は⌘)キーによるシーケンスビューのアイテムの選択ができなくなる不具合を修正。チューブ表示の先端を半球状に変更。ボールをポイントスプライトで表示した時、色合いがおかしかったため修正。zSpaceで描画した際、左目右目が反転する不具合を修正。zSpaceで分子をピックした時にバイブレーションで知らせる機能を追加。新機能・修正点フレームシーケンシャルの3D表示を、全画面で行える機能を追加。グラフィックスボードを利用しているマシンで、ポイントスプライトによる球の表示と、ポイントスプライトのON・OFFを切り替える機能を追加。mol2/molファイルの読み込みで、ファイルに記載のない結合が追加される不具合を修正。分子の自動回転に首振り機能を追加。Retinaディスプレイで動画の作成や高品質イメージ出力以外の画像の書き出しを行うと左下4分の1だけが出力される不具合を修正。(Mac版の場合のみ)Qtライブラリの影響でドラッグ&ドロップしたファイルが読み込めなくなっていた不具合を修正。Yosemiteの場合のみ)その他細かい不具合を修正。以下のような選択式で原子選択ができるようになりました。resname:ALA現在選択中の原子で残基名が”ALA”の原子スクリプト実行機能Pythonスクリプトを使ってMolFeatを操作できるようになりました。ユーザーインターフェースからできる操作とほぼ同等の操作がスクリプトより可能です。以下のようなことができます。MolFeatコントロール上でもスクリプトを実行可能です。簡単な分子アニメーション操作内容の記録機能ユーザーインターフェースに対しておこなった操作を記録し、その内容をPythonスクリプトとして出力できます。半透明ポリゴン描画処理の改良シーケンスビューの機能強化シーンウィンドウ中でクリックした原子を、シーケンスビュー上にスクロールして表示しますシーケンスビューの表示モードを切り替えたときに以前の表示位置を保ちます。分子の分離機能の強化1つの分子データを選択原子とそうでない原子で分離できます。分子サーフィスへ独自色設定スクリプトを介して、分子サーフィスへ頂点単位で独自色を設定できます。新機能・修正点ムービーファイル作成機能AVIファイルを作成します。原子数が99999個以上のPDBファイルを読み込めるようにしました。データのマージ指定した複数の分子データをマージして1つの分子データにします。み込んだ1つの電子密度データに複数の表示領域を作成できるようになりました。表示領域は、選択した複数の原子を中心に作成ができます。これまでのワイヤーフレームの表示だけでなく、ポリゴン、ドット表示もできるようになりました。シーケンスビューシーケンスを折り返して表示するモードを追加しました。複数の分子データの表示にも対応しました。疎水性インデックスでの色づけに対応しました。主鎖2面角φ、ψのファイル出力1つの分子データの2面角φ、ψをファイルに出力できるようになりました。プロット可能な形式です。平行投影のサポートステレオ表示モード水平インターリーブ方式に対応しました。指定した分子の対称構造の計算PDBに記録された単位胞および空間群の情報を使って、指定した分子の対称構造を計算して表示します。なく、すべての原子に対して水素結合を計算します。指定原子を中心に半径何Å以内の原子選択をできるようにします。自動回転の回転軸、回転スピードを指定できるようにします。ポテンシャルの計算と可視化タンパク質分子、核酸分子の静電ポテンシャルを計算し可視化します。計算にはAMBERのテンプレートデータを使用しています。配色設定により、静電ポテンシャル値に対応する色を編集可能です。読み込んだ分子データを一覧で表示、選択するためのビューです。このビューを使用すると編集対象分子を複数選択できるようになります。すべての分子形状のクリッピング分子サーフィス形状以外に、ボール、リボンの形状などもクリップ可能です。計測後、その結果を3次元空間中に注釈として残せます。以下が強化されています。残基で置換え可能です。構造最適化などの処理はおこなっていません。(税別)教育機関向けは3ライセンス付属します。ひとつのサイト(同一敷地内)で複数のライセンスをご利用いただく場合、サイトライセンスの複数ユーザパッケージプランも準備しております。サイトライセンスをご希望の場合はこちらまでお問い合わせください。弊社は特定の代理店を設けておりません。基本的にお客様と直接取引をいたしております。ご注文の際は、こちらからお問い合わせください。マニュアルはPDFファイルでご用意しており、必要に応じてお客様に印刷していただいております。1-3-3プロスパービル8FTEL:03-5822-4110FAX:03-3862-9190Top。