設立当初から、世襲が基本だった当時の商習慣を廃し、また現在で言うところの株主と社員を分けた組織で運営するなど、事実上日本初の株式会社として知られる。福沢諭吉の門人・早矢仕有的(はやしゆうてき)である。丸善は近代日本に於ける西洋の文化・学術紹介に貢献し、その紹介する商品によって培われた気風は「丸善文化」と呼ばれ、多くの文化人に愛された。1999年、プリンストン債事件に巻き込まれ、56億円もの多額の特別損失を計上し、現在財務体質を改善中。2004年にはIT関係子会社を統合後、京セラコミュニケーションシステムと資本・業務提携し、新会社「京セラ丸善システムインテグレーション(KMSI)」を設立、27.3%を出資している。まで幅広く手がけており、創業時よりの商社的性質が現在も残る。ちなみに、ハヤシライスは創業者の早矢仕有的が考案したという説があるが、『丸善百年史』ではそれを否定し、有的との間接的な関係を述べている(しかし、丸善ではハヤシソースの缶詰が売られている)。メーカーのマルゼン、エアソフトガンメーカーのマルゼンとは無関係。2005年5月、ウイルスに感染した電子メールを同社の発行するメールマガジンに登録した会員1万6000人に送りつける騒ぎをおこした。その際、対応の悪さが目立ちメールマガジンを解約する顧客が増えた。2005年8月3日、経済産業省に提出した産業再生法に基づく事業再構築計画が認定され、登録免許税の軽減措置を受けることとなった。技術提供:Blogger.。