例として、以下の予測配列を用いる。ディレクトリの中に入れる。ライブラリーへのパスを与える。ディレクトリに保存される。ペアワイズアラインメントが保存されている。内容を見ると、以下のようになっている。利用できるように作られている。ウェブページに公開されている。該当ページに移動し、検索フォームにアミノ酸配列を入力すれば、簡単に検索を行うことができる。メールアドレスの入力も求められる。プログラムの実行が終了すると、検索結果が入力したメールアドレスに送信される。結果メール中に記載されたリンクをクリックすると検索結果を見ることができる。alignments」がクエリー配列とテンプレート配列のアライメントである。