89年からバイエルン国立歌劇場でW.サヴァリッシュ氏のもと研鑚を積む。94年東京交響楽団の専属指揮者に就任し、同楽団のポルトガル演奏旅行で成功をおさめた。続く96年には東京交響楽団創立50周年記念ヨーロッパツアーを指揮、特にミュンヘン公演は南ドイツ新聞で「今後、イイモリの名が世界で注目されるであろう」と絶賛された。95年から大阪のザ・カレッジ・オペラハウスを本拠とするオペラハウス管弦楽団の常任指揮者となり、01年から首席指揮者、02年には名誉指揮者の称号を受ける。(マーラー:交響曲第1番)は、年間ベスト10コンサートに選出された。04年シーズンより山形交響楽団の常任指揮者に着任し、モーツァルトの交響曲を8年がかりで全曲演奏するプロジェクトや、自主レーベルでのCDリリースなど次々と新機軸を打ち出し、オーケストラの活動発展と水準の向上に目覚しい成果を挙げている。07年より音楽監督に就任。08年にはアカデミー賞映画「おくりびと」にも出演するなど、「飯森&山響」コンビのエネルギッシュな活動はいま大きな注目を集めている。オーケストラをダイナミックに革新し、地域活性化に貢献したことから、2010年のビジネス・イノベーション・アワード大賞を受賞した。中島健蔵音楽賞を相次いで受賞した。東京交響楽団とは07年にヘンツェのオペラ「ルプパ」の日本初演、09年にヤナーチェクのオペラ「ブロウチェク氏の旅行」も手がけており、いずれもセンセーショナルな成功を収めた。海外ではフランクフルト放送響、ケルン放送響、チェコフィル、モスクワ放送響など世界的なオーケストラを指揮。(ドイツ)、バーゼル響(スイス)に客演。ケルン放送響との放送録音も行っている。最近ではホノルル交響楽団とのプロコフィエフ「アレクサンドル・ネフスキー」、プラハ交響楽団とのR.コルサコフ「シエェラザード」が大絶賛を受けた。