分離機構の違いにより異なる名称で呼ばれています。いう名称で区別されています。種々の化合物の分離に活用されています。CEとEKCはいずれも分離の媒体として自由溶液を用います。CGEの分離機構は先に述べたスラブゲル電気泳動法と同様,ゲルの網目構造による分子ふるい効果に基づきます。キャピラリーゲル電気泳動法は,迅速性,簡便性,分解能,定量性などの点でスラブゲル電気泳動より優れているといえますが,分取あるいは精製の目的には適していません。