これを運営委員会方式と言います。運営委員会の下に、児童の保護者による父母会が組織されています。実質的な運営は父母会が担います。さまざまな職種、経験の保護者が、知恵と力を出し合って運営しています。学童保育でのイベントのほか、父母会の会議が定期的に行い、運営等さまざま検討しています。親に代わって保育をするのは、指導員と呼ばれる保育の専門家です。資格を持った指導員がいなければなりません。誰でもなれるわけではありません。都道府県から認定証が発行されます。連携など、学童保育を行う上で欠かせない幅広い知識と理解を習得することが目的となっています。