4MrBUMP用にインストールする場合はv34を使用してください。このプログラムはMakefileが用意されているので適切なMakefileを選択してコンパイルします。Compilerを使うのでMakefile.linux_icc_sse2を選択しました。III以前のプロセッサなど)はMakefile.linux_iccでいいと思います。インストールディレクトリを指定します後は/usr/local/bin/fasta35にパスを通せば使えます。ここでは/usr/local/bin/fasta35にしましたが、/usr/local/binにインストールしても問題ないと思います。4MrBUMPではfasta34が必要と書いてあるのでインストールします。fasta35では代用できませんでした。EBIのサイトからfasta-34.26.5.shar.Zをダウンロードします。このファイルはCompress圧縮形式+シェルアーカイブ形式でアーカイブされています(シェルアーカイブ形式って知らなかった・・・)。ダウンロードしたら展開します。ダウンロードした場所の下位にfasta-34ディレクトリを作成します。shこれでファイルが展開されます。make以降はv35と同じです。Compiler版のMakefileがないのでGCC版でコンパイルしました。SSE2対応コンパイルが通らなかったのでMakefile.linuxを使いました。