記録達成を記念して特例による名球会入会が認められたがこれも固辞し、同年9月1日の対ロッテオリオンズ戦で田村勲から中前打を放ち、史上17人目となる通算2000本安打を達成して正式に入会した。このシーズンの盗塁は55に終わり、60盗塁を記録した大石大二郎(近鉄)に連続盗塁王の記録を13年で阻まれた[34]。福本によると、939盗塁の達成前に「しんどかった」ことに加え、大石が自分と同じタイプの選手で「西本さんの教え子」でもあることから、「もう走れへんから、(タイトルを)お前にやるわ」と言ったという[34]。連続記録に「こだわりはなかった」というが、相手が大石でなかったら「きっと14年連続を目指して、頑張っていたと思う」とも述べている[34]。1984年8月7日には1000盗塁に到達。その後は記録を1065まで伸ばした。1000盗塁を超えてからは、誕生日(11月7日)にちなんだ通算1107盗塁を個人的な目標にしていたという[35]。1985年頃からはレフトを守る機会が増え、盗塁のサインがダグアウトから出されるようになる[36]。)で佐藤健一のライナーを無理に取ろうとして右肩を脱臼する[36]。救急搬送された病院での診断は「全治2か月」であったが、かかりつけの整体師(愛知県在住)に「任せてダメなら引退する」覚悟で2日おきに診察を受け、2週間で復帰した[36]。この年のオールスター戦には監督推薦で出場、盗塁を試みたが失敗に終わる、これについて「知らないうちに足が動いていた」とコメントしている[要出典]。これが福本が出場した最後のオールスター戦となった。1988年のシーズンにはスタメンに入ったのは23試合にとどまり、出場試合数も92に減った(福良淳一、ダラス・ウイリアムズなどが主な1番打者となる)[41]。シーズン終了間際の10月19日、ブレーブスのオリエント・リースへの売却が伝えられた。後の福本の回想によると、その日は来季の身分を、選手兼任コーチと専任コーチのいずれにするかの回答を球団から伝えられる予定だったが、売却により白紙になったという[43]。阪急球団が作成していた1989年カレンダーには1月の箇所に「外野手」として打席での福本の写真があしらわれていた[44]。10月23日、阪急ブレーブスとしての西宮球場最終戦があり、試合後の挨拶で監督の上田が「去る山田久志、そして残る福本」と言うつもりだったものを、間違えて「去る山田、そして福本」と言ってしまい、チームのみならずファン・マスコミを巻き込んだ大騒動に発展した[45]。福本は殺到するマスコミを前に「上田監督が言ったなら辞めます」と言い、そのまま40歳で現役を引退した。早くから引退を示唆していた山田に対して、急に引退すると決めた福本は周囲から「冷たい奴や」と言われたと回顧している[14]。後年、この時のことについて「引退を取り消すのが面倒くさかった」とも、「体力的にはあと3年はやれたけどね」とも語っている[46]。『ベースボール・マガジン』など一部メディアでは、前日にコーチ要請を受け、阪急もなくなると言うことで引退を決めたと書かれている。『週刊ベースボール』でのインタビューによれば、当初は自由契約を希望したものの、受け入れられず任意引退の形を取られ(取らされ)、それならばと思いコーチ兼任を希望したが拒否されたという[45]。結果的に知人のアドバイスにより引退を決意した[45]。一時は阪神タイガースへの移籍も考えていたという[44]。他方で、その8日前、阪急身売りが公表される前の10月15日、毎日放送の野球中継中(南海対近鉄第25回戦)、門田博光の活躍に触れる際、同年代の選手として引き合いに出す形で福本がその年限りで辞めると述べていたことが井上光央アナウンサーによって言及されている[出典無効]。現役最末期の福本は盗塁数が極端に減っていたが、これは出塁しても「待て」のサインが出るようになったためで、これにプライドを傷つけられていたことも引退の一因になっていると語っている[14]。1989年3月の引退試合(対巨人オープン戦・西宮球場)では、山田とともに阪急のユニフォームで出場し、福本は打席に入って香田勲男と対戦した。1989年はオリックスの一軍打撃コーチ、1990年から1991年まで同球団二軍監督を務めた。1989年に移籍してきた門田博光の相手を「ほかの誰の手にも負えない大きな存在」という理由で任されたが、同学年で現役の門田を見ると「僕かて野球を続けたかったのに...」と悔しさが募ったと回想している[47]。1992年から1997年まで6年間朝日放送(現:朝日放送テレビ)・サンテレビジョンの野球解説者を務める。この間の1992年6月16日、MLBのリッキー・ヘンダーソンが福本の持つNPB通算盗塁記録を超える1066盗塁を記録した。ヘンダーソンが福本の記録に近づいた際、福本は記録を破る瞬間を見届けるべく渡米している。ヘンダーソンは、福本が始球式を務めたその試合で見事福本の記録を抜いた。福本はヘンダーソンを祝福し、金色のスパイクをプレゼントしたのに対して、ヘンダーソンは試合後、記録を達成した時の二塁ベースをプレゼントした。福本はヘンダーソンの身体能力、特に盗塁・帰塁の1歩目を「まるでベン・ジョンソンのスタートのようだった。自分の筋力ではできない」と絶賛し、ヘンダーソンも福本について「尊敬に値する人物」と述べた。1998年に阪神タイガースの一軍打撃コーチに就任。これは監督の吉田義男から打撃コーチとして招聘を受け、打撃を若い選手に伝えたいという年来の希望が叶うことから、守備走塁コーチとして先にオファーのあった巨人を断って受諾したものだった[48]。コーチに配置替えとなり、その年で退任した。テレビ・サンテレビジョンの野球解説者、スポーツ報知で野球評論家として活動している。2002年に野球殿堂入り。