日本国内の生物種については、環境庁が日本版レッドリストの作成とレッドデータブックの編纂を行っている。日本版レッドリストではIUCNのカテゴリーに基づいた独自のカテゴリーが用いられている。地域個体群(LP)2000年版から2004年版への変更点ペンギンについては、2004年版レッドリストでは大きな変化がありませんでした。リスク種レッドリストのペンギンシュレーターペンギンキガシラペンギンガラパゴスペンギンイワトビペンギンマカロニペンギンフィヨルドランドペンギンスネアーズペンギンロイヤルペンギンケープペンギンフンボルトペンギンジェンツーペンギンマゼランペンギン。