研究実績の概要エピトランスクリプトーム(RNAの修飾)解析はエピゲノム(DNAの修飾)とは異なり、末梢血のエクソゾーム中のマイクロRNAから直接情報を得ることができる。はじめとする様々な生物学的な機能を制御していることが明らかとなった。マイクロRNAのメチル化情報をデータベース化することは、疾患のコンパニオン診断として重要である。本計画では、手術切除標本とリキッドバイオプシー(膵がん、胆道がん年間各20症例)に私たちの新技術で簡便にm6Aを計測する方法を確立し、膵がん、胆道がんの手術材料と末梢血のマイクロRNAのメチル化を比較検討し、創薬と診断を融合させるデータベースを構築した。RNA修飾に基づくがんの悪性度診断と新たな治療標的の開発に貢献した。当初の計画以上に進展している理由1m6A計測法の確立:m6A計測法は大阪大学の基本技術として確立した質量分析法と、トンネル電流シークエンス法により実施した。Decayで計測し、m6Aを読んだ。並行したTS法として、一分子レベルのシグナルを計測した。2対象となる材料間の比較:膵がんと胆道がんのそれぞれ20症例から手術で切除した腫瘍から抽出したmRNAとマイクロRNAのメチル化を検討した。同じ患者から末梢血3mLから血清エクソゾームを分離してマイクロRNAを抽出し計測した。解析にあたっての倫理申請と承認はすでに得られた。今後の研究の推進方策m6Aの疾患データ解析:機械学習(深層学習、AI)、統計解析を経てデータを格納する。従来のDNAシークエンサーが200リード以上の重複を必要とすることに比べて10以下の重複度で99.9%の識別精度を達成できており、本研究で生データを格納することにより臨床材料においても根本的に異なる高いスループットが期待される。公的バンクに登録し、データ共有を進める。m6Aエピトランスクリプトームの標的化を進め臨床応用による社会実装を促進していく。