この場合は、個体間の系図は考慮せず、種と種の間の分岐関係のみを考慮する。種が大きな個体数を保ったまま短時間で別種に進化するといったごく希なケースを除けば、個体としてのMRCAの個体は、種としてのLCAの種の一員であると考えられる。現生哺乳類のLCA)は、その系統に含まれる全ての種のLCAを言っている。最初の生命とは異なる概念である。最初の生命はむしろ、(現在の生命の祖先だとして)「最も遠い」共通祖先であり、LUCAよりさらに古い祖先である。生物そのものではなく、それらが持つ遺伝子に対しても最も新しい共通祖先を定義できる。複数の個体や種が持つ対応する遺伝子だけでなく、遺伝子重複が起こった場合は、同じ個体や種が持っている、同じ起源の複数の遺伝子に対しても、最も近い共通祖先を定義できる。単純に考えると、遺伝子のMRCAは、それを持つ個体のMRCAが持っているように思える。有性生殖をする場合は、遺伝子の親子関係は単純な分岐なのに対し、個体の親子関係は網目状で急激に広がるので、遺伝子のMRCAは個体のMRCAより古い。ミトコンドリアDNAやY染色体は、交叉の単位としては、他のゲノムと交換されない単一の遺伝子とみなすことができる。ミトコンドリア・イヴやY染色体アダムは、本質的には遺伝子のMRCAである。種間の場合には、基本的に遺伝子のLCAは種のLCAが持っている。遺伝子重複が起こり、それらのうち片方が消滅し、しかもどちらが消滅したかが種によって異なる場合は、遺伝子のLCAは種のLCAよりはるかに古くなる。(Y染色体)ジェノグラフィック・プロジェクトスペンサー・ウェルズこの項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めています(プロジェクト:生命科学/Portal:生物学)。3.0のもとで利用可能です。プライバシーデスクトップ。