互いの譲れない思いがぶつかり合う。あの男もまた、かつての自分と同じだということに。今まさに、グランドラインに突入しようとする若き海賊達がいた。〝ゴム人間〟のモンキー・D・ルフィ。“海賊狩り”こと、ロロノア・ゾロ。“海のコック”サンジ。彼ら「麦わらの一味」は、酒樽の上に足を乗せ、偉大なる海に誓いを立てていた。ルフィは、「おれは海賊王!!」と叫ぶ。―時は遡り、フーシャ村。少年時代のルフィは、海賊頭、“赤髪のシャンクス”と交流を深めていた。そこに山賊が現れ、海賊達は馬鹿にされ笑われる。「何で戦わないんだよ!!」と憤るルフィだったが、シャンクスは怒るほどでもないという。数日後、再び山賊達に囲まれてしまったルフィ。そこへ駆け付けたのはシャンクスだった。クス達、海賊の強さは本物で、山賊達を圧倒する。逃げ出した山賊の頭・ヒグマは、ルフィを攫って海へ向かう。さらば友よ戦いの末に自分たちの世界を取り戻し、それぞれが生きるべき場所へと戻ったガッチャマン=健、テッカマン=城二、ポリマー=武士、キャシャーン=鉄也の4人。彼らはある目的のため、笑と共に再び時空を超えて一つの世界へと降り立った。そこは平和を脅かす人類の敵「ギャラクター」が猛威を振るい、それに対抗するガッチャマン率いる「科学忍者隊」が戦い続けた世界。その世界の様子に違和感を覚える彼らの前に、一人の男が姿を現す。ったはずの健に不審な表情を向ける南部は、ヒーローたちに思わぬ言葉を告げる。「どうやら君たちは私の敵らしい」と......。その様子をビルの上から見つめる一つの影があった。