同時に設置された「統合幕僚会議」という組織があったが、統合幕僚監部はこの機能を拡張し、各自衛隊の統合運用を目指して2006年3月に設置されたものである。長である「統合幕僚長」は全自衛官のトップであり、防衛省のトップである防衛大臣に対して軍事専門家として一元的に補佐する役割を持つ。このため、このポストに任じられた陸海空将は陸上・海上・航空の各幕僚長である将と同様、外国軍の大将に匹敵する階級として扱われる。行動に関する法的支援に従事する。