生息するほ乳類は、現在までに34種が確認されています。大型のものは、ツキノワグマ、ニホンカモシカで、尾瀬やその周辺の山々にかけて生息しています。姿を直接見かける機会はあまりありませんが、糞などを登山道などで見かけることがあります。ほ乳類の中で比較的目撃例が多いのが、オコジョという体長20センチほどのイタチ科の動物です。オコジョは夏は背中が濃い茶色でお腹は白色ですが、冬になるとしっぽの先の黒色を残すほかは、全身まっ白の毛に生えかわります。イタチの仲間は肉食性で、オコジョは主にネズミのような小さな動物を食べますが、時にはウサギなどの自分より体の大きい動物までをも捕らえます。かわいらしい姿に似合わず、かなりどう猛な性格をしているようです。このほかキツネやタヌキ、コウモリなどの動物も生息しています。登山道や木道の上を歩くとき、糞など動物たちの痕跡(こんせき)がないかよーく注意して見てみましょう。