Folder"を手動で行っていたのでしょう。自動で適用させないためには、(A)ルールを無効にする、か、(B)メッセージフィルターを定義しない、しかありません。受信時のフィルターの自動適用を行わせないためには、(B)しか手段はありません。Folder"も使えません。Folder"を手動で行う、ということになります。フィルターを、メールフォルダー単位で定義できるようになれば、問題はないんですけどね。Folder"、という形をとることになります。Folderあるいはダミーのアカウントの、受信トレイなり自分で作ったメールフォルダーに手動で移動し、そこで手動でフィルターを実行するだけで充分、という話になります。追加されるといいのですが..メッセージフィルターがアカウント単位でしか定義できないのに、そのアカウント単位で受信時にメッセージフィルターを適用するかしないかをユーザーが選択できない、というのがそもそもの問題であって、(4)の動きだけの問題じゃないです。「ユーザーが選択できない」ための、不都合がでてきます。メール管理用のダミーアカウントを作って手動でのメールの整理は全てそちらで行う、というような逃げが効かない分、IMAPの場合の方が深刻な問題になりそうです。