大型連休があけてすぐの発行となりました。皆様充実のお休みを過ごされたことと思います。爽やかな季節、充電もばっちりで、気持ちよくお仕事を再開して参りましょう。...............昨年度の「すにっぷすいすい・番外編」リーゾの受託サービス「すにっぷすいすい」は、本来はSNP(一塩基多型)を判定するためのPCRマーカー(プライマーセット)をお作りするサービスです。お客様から、「こんなことはできる?してもらえる?」というご相談をいただくことが多くあります。無理なものは泣く泣くお断りしていますが)。そこで今回は、昨年度いただいたご相談で、お引き受けできたものをご紹介したいと思います。<お客様や研究内容が特定されないよう、生物種や詳細をぼかして表現しておりますことをご了解ください。身の回りの環境には、たくさんの生物種が共存していますが、その中に目的とする生物種がそもそも「存在しているのか」どうかを調べることはなかなか難しいものです。相互に識別して増幅できるプライマーの設計をお引き受けしました。ご指定の生物種全てについて、ある遺伝子の配列をデータベースから取得して、アライメントを取り、それぞれの生物種に特異的な配列を同定してプライマーを設計します。それぞれの生物種の内部にも変異があるので、「種内変異」を拾わないように気をつけて設計します。最後に、お預りした全てのDNAで確認PCRを行い、目的の生物種だけが増幅することを確認します。このケースでは、リアルタイムPCRでの利用が前提でしたので、念のためSYBR入りで反応して融解曲線を取り、シングルピークを確認するところまで行いました。約100bpの配列が数回繰り返す構造において、SNPを有する繰り返し単位を持つ個体かどうかを判定するマーカーを作りたい、とのご依頼です。その繰り返し単位が何回目の繰り返しにあたるのかもわかるとうれしい、ということでした。下流側のプライマーを、繰り返しが終了した後の共通配列部分に設計しました。これにより、ほぼ100bp間隔のラダー状の電気泳動像が得られ、そのバンドの位置で、全ての繰り返し単位のSNPの塩基種が一度に判定できるマーカーを作ることができました。(3)複雑なゲノム構造を有する植物種におけるSSRマーカーの改良SSRマーカーは通常、1本(ホモの場合)または2本(ヘテロの場合)のPCR産物が得られますが、ゲノム構造が複雑な場合はたくさんのバンドが増えてきて判定が困難になります。そこで、特定のバンドだけを増やすようにSSRマーカーを改良してほしい、とのご依頼を受けました。難しいご相談ですが、増幅するバンドの間で、SSR以外にSNPがあれば何とかなるだろうと考えました。そこで、SSRを含む1kbの断片を増やすプライマーを設計し、まずはまとめて増幅。これをクローニングし、ランダムに20個をシーケンシング。使いやすいマーカー化への道が開けました。某生物種の親子鑑定/異同の鑑定(オルガネラ遺伝子で比較)など、いろいろなご依頼がありました。ほんとうに、思いもかけない、多種多様なニーズがあって驚きます。リーゾの受託サービスは、お客様からいただくご相談で進化・成長しているようなものです。解決策がひらめいたりすることもあります。ご紹介したものと似たようなケースでお悩みの研究者さんがいらっしゃいましたら、あるいはもっと難しいお悩みでも、「ダメもと」で一度ご相談ください。新潟県の魚沼のおみやげに「雪下にんじん」をたくさんいただきました。ちなみに「雪下にんじん」とは、秋に収穫するはずのにんじんを、数メートルの雪の下に春まで寝かせておいてから掘り出すという方法で作られる、生食用の美味しいにんじんです。生でかじってみると、にんじん特有の青臭さがなく、シャキシャキとみずみずしい歯ざわりで食べやすい。甘いだけでなく、深い味わいが後を引く感じです。これは調べてみなくては・・・。いうわけで文献検索したところ、12月から4月にかけて雪の下のにんじんを定期的に掘り出し、成分分析したというふたつの研究報告を見つけました。化していませんでした。して「甘い」と感じるのかというと、甘みや旨みを呈するアミノ酸(アスパラギン、グリシン、セリン等)が3倍以上に増加しているからなんですね。深い味わい、と感じたのはアミノ酸だったようです(※1)。にんじん特有の青臭さがなく、香りが良い、とされている理由もわかりました。全香気成分の32%にまで急増します。にんじん特有の、パセリっぽいにおいの原因となる成分は、(それ自体も減るのですが)カリオフィレンが増えたために相対的に少なくなり、ほとんど感じられなくなるようです(※1、※2)。感については、研究データは見つけられなかったのですが、雪の下だと乾燥も凍結もせず、新鮮な状態が維持できることと、もしかしたら低温により、細胞内に多糖類が増加して、ハリのある状態になっている、ということも原因しているかもしれません。ここで、リーゾスタッフに教わった、雪下にんじんを使ったお勧め料理、フランスのニンジンサラダ「キャロット・ラペ」のご紹介です。塩・こしょう少々、を混ぜるこれで、できあがり。シンプル!にんじんにはビタミンCを分解する「アスコルビナーゼ」が多いため、生で食べるとよくない、と言われていますが、「酢」を加えるこのレシピなら問題ありません。ビネガーをバルサミコに、オリーブオイルをごま油に、黒砂糖をはちみつに変えるのも美味しいそうです。お好みで、ナッツやハーブを混ぜても。肉料理の付け合せにも、お弁当の彩りにも、ワインのつまみにもグッド。「常備できるサラダ」として、食卓の助っ人になりそうなメニューです(多忙な主婦にはありがたい・・・)。持にお役立てください。.........空気って重さはあるのかな児童館などで、サイエンスショーを行う活動をしているKUBOさんに、家庭でもできるかんたんな理科実験を教えていただくシリーズ。2回目の今回は、空気を使った実験です。きゅうばん(吸盤)を作ろうです。「空気には重さがあるのかな?」いまどきの子供たち、「あるよ!」と答える子が多いそうです。手で扇いで風を起こしてみると、空気の存在を感じることができます。袋に詰め込んで、秤に乗せたら量れそうですよね。そこで、ビーチボールとペットボトルに空気を詰めてみます。ペットボトルのほうは、「フィズキーパー」(炭酸が抜けないようにする器具)を使って、しゅぽしゅぽと詰め込みます。班のこどもたちに1人5回ずつ押してもらいます(最後の子は結構たいへん!)。重さを量ってみると・・・ビーチボールは、あれ?変わっていません。?ペットボトルの方は、1グラムほど、重くなっていることがわかります。詰め込むと、重さが量れるんですね。度が下がり、空気中の気体の水(水蒸気)が氷や水になって雲が出現します。(・・・そういえば『断熱膨張』という言葉、思い出しませんか?)次に、「空気を抜いていくとどうなるかな?」という実験です。この実験には、「真空調理器」とか、真空にできるお弁当箱などが使えます。中にボールや風船を入れて空気を抜いてみると、割れそうで怖いくらい、中でパンパンに膨れます。マシュマロも大きくなります。羽と鋼球を入れて、空気を抜く前と後で、落ち方が違うのを観察するのも面白いです。こどもたちに工作してもらう、吸盤の実験です。用意するものは、コップ(そこにワリバシ1本が通る穴をあける)、クリアファイル(コップのふちを覆う大きさで四角にカット)、画びょう、ガムテープ。それに、小さな円盤状のゴム板にぎりぎりの大きさの穴を開けてストローを通したものも用意します。クリアファイルに画びょうを付け、それに割り箸をさし、それにプラカップをかぶせて吸盤の完成。ためしに、滑らかな机の上に、吸盤をポンとおいてみましょう。見事!くっついて持ち上がりませんよ。テレビや冷蔵庫など縦のものには、どうかな・・・?上手になると、くっつけられるようです。ここからKUBOさんにインタビュー。Q:この実験を思いついたきっかけは?最初にご紹介いただいた、ビーチボールとペットボトルに空気を詰める実験ですが、どちらも、重くなると思っていました。ビーチボールは、重くならないのですよね。みなさんは、どうしてだかすぐにわかりましたか?はかりの上に置いた凹んだビーチボールをイメージしてください。これにいくら空気を入れても、そこにあった空気がビーチボールの中に入っただけで、はかりの上の状態は変わっていないのですよね。最後にご紹介いただくリンク先に、PDFで説明を入れているので、興味のある方はご覧下さい。Q:この実験で苦労したこと、困ったこと、工夫したことは?真空調理器で空気を抜く作業やフィズキーパーで空気を詰め込む作業は、見ている子どもにとっては、何が起こっているのかイメージしにくいようです。転車の空気入れと違って、あまりなじみのない作業ですもんね。このあたりを感じてもらうのに、苦労します。参加のこどもたちに、しゅぽしゅぽ空気を入れたりして、実際に作業してもらうようにしています。それに、一人でやっていたら、次の日は筋肉痛ですもんね!Q:この実験教室を上手にみせるコツは?この実験で、こどもたちが興味を示すのは、真空調理器での実験です。真空調理器は小さいので、大勢で見るには、見にくいのですよね。おうちにお持ちの方は、ぜひ、いろいろ試してみてくださいね。マシュマロのほかには、シェービングクリーム・生クリーム・ちっちゃな袋詰めのお菓子・などが楽しいです。こどもたちは、ピーマンは膨らむかな?なんて言っていましたよ。クリーム系は、アルミ皿にのせるなどしないと、あふれて、次のものがためせなくなります。それと、リンク先にあるお湯を沸騰させる実験は、真空調理器では再現しにくいようです。Q:この実験を行うとき、注意すべきことは?画びょう・割り箸などを使うので、取り扱いには、注意してくださいね。あまりにも身近にある「空気」で、こんなにいろいろな実験ができるんですね。つきのご案内2期目の田んぼ栽培を開始した『美食同玄米』(コシヒカリつくば黒1号)。様優先でご提供します。リーゾのワクワク感をおすそ分けする、赤字必至の大サービス。数量限定、早いもの勝ちです。よろしければぜひどうぞ。コースの3つ(各5,400円(税込、送料無料))。各5セット(3は10セット)限定です。詳しくは、こちらをご覧ください。実験補助の仕事の概要を学ぶ「ガイダンスセミナー」を行いました。今回は4名がご参加くださいました。次回は5月21日(水)の同じ時間、同じ場所で、「微量の液体の取り扱い法」を行います。今後のセミナーの詳細はリーゾのHPをご覧ください。作りました2月3日につくば市役所で行った表記セミナーの内容を小冊子にまとめました。パワーポイント資料に従って、お話を進めていくバーチャルセミナー形式になっています。当日いただいた質問への回答、参加者にいただいたご感想も載せてあります。味のある方、自信をもって一歩踏み出す勇気がきっと得られます。リーゾのホームページにて「立ち読み」をどうぞ。...............○先月、20数年ぶりに、自宅の「引越し」をしました。モノが少ないと思っていたのは全くの勘違いで、意外な荷物の多さに驚愕しました。駄をそぎ落として、リーゾ並みにコンパクトでミニマムな我が家にしたいとの野望を密かに抱いています(・・・たぶん無理)。忙時の助っ人スタッフとして、採用することができました。公募でしたが、蓋を開けたら全員知り合い(セミナー受講生)。公募になってないじゃん!と思う反面、気心の知れたスタッフを確保できてうれしいです。「主婦力」でますますパワーアップしたリーゾにご期待ください。○「交配袋の素材で、芽出し(催芽)用の袋を作れないか」というご相談を立て続けにお受けしています。ご希望の形状とサイズで試作してはお出ししていますが、これは結構需要あるのかも?とちょっとわくわくしています。ご興味ある研究者さん、お気軽にご相談くださいね。○最後までお読みいただき、ありがとうございました。これからも、リーゾとすいすい通信をどうぞよろしくお願いいたします。(も)すいすい通信は、「株式会社リーゾ」のお客様、および関係者の皆様にお送りしています。この号は421名様に配信しました。お知り合いで、「すいすい通信」の配信を承認していただける方がいらっしゃいましたら、ぜひご紹介くださいますよう、お願いいたします。FAX:020-4623-5611MAIL:info*rizo.co.jpHP:http://www.rizo.co.jp/※本メールは「MSゴシック」などの等幅フォントで最適に表示されます。