全世界で突如、「亜人」と呼ばれる人間が現れはじめる亜人は殺されても死なない不死身の体を持ち、特殊な物質を放出することにより、自分の分身を作ることが出来る亜人の謎を解明するため、日本政府は秘密裏に様々な生体実験を行うが、被験者が逃走してテロリストとして復讐を始める主人公は医者を目指す高校生。高校の友人達のちょっとしたいたずらによって学校の倉庫に閉じ込められてしまった天宮晴輝と磯波きらら。...なぜか何時間たっても扉を開けてくれない。マイペースな性格をした高校生のサブローは、下校途中に崖から落ちたことによりタイムスリップしてしまう。気がつくとそこは戦国時代。悪しき霊的存在「ケガレ」と陰陽師達の、長きに渡る因縁の戦い。主人公は、かつて陰陽師を目指し、ある人物の陰謀により右腕だけケガレにされた少年。