†3-4をクリアすると、第3章救援任務ステージ「SOS商船救援」が開放される。この海域は3-4の次という意味で一般に3-5と呼ばれている。この海域には常時出撃できるわけではなく、受信した「救助信号」の発信源を探知し、救援任務ステージを出現させる必要がある。※救助信号の受信は時間経過による。30分毎にランダムで判定される模様。救助信号海域のボスは潜水艦、潜航中の潜水艦を発見する為には駆逐艦または軽巡洋艦の設備欄にソナーを装備する必要がある。爆雷投射機は装備しなくても攻撃できるが、大きくダメージが変わるので装備しておいた方が良い。(ソナーと爆雷投射機は、3-4クリア時に任務報酬としてそれぞれ1つもらえる)この他、軽空母の設備欄に対潜攻撃機を装備しておけば発見した潜水艦を自動的に攻撃する。史実で搭載機による潜水艦撃沈の戦果を挙げた戦艦ウォースパイト改にも例外的に、対潜機を搭載できる。救助信号ステージに出現する全ての敵艦隊に潜水艦が存在する。発見されてから12時間、マップ上に表示される特殊ステージ。待ち伏せや空襲など、いわゆる「見ゆ」はないが、海域危険度も存在しない。マップには「?」や弾薬補給も出現せず、敵を全滅させる等の任務もない。攻略中に12時間経過してしまうとマップから追い出される。ある程度は余裕を持ってクリアできるようにしておこう。救助信号海域でドロップする艦は、その章の第4ステージの艦。3章から救助信号があった場合は、ドロップは3-4と同等となり赤城や加賀(空母)を入手できる可能性がある。中枢ステージはボスが潜水艦と入れ替わった状態であり、9章のハマカゼ・タニカゼ以外はボスおよびボスの取り巻きが登場しない。チュートリアルでは配布された伊58を使って潜水艦隊を組むが、救助海域に潜水艦を連れていく必要はまったくない。潜水艦の支援範囲で戦闘に入って呼び出せば有利になるが、潜水艦は対潜攻撃は不可。6・7・9章はボス出現までに5戦、10章は6戦必要なので弾薬切れに注意。自爆ボートの数がやたらと多い。ボス戦では平然と4隻同時突撃をかましてくるなど。装備(設備)...★2までのソナーと爆雷投射機は設計図でなく現物が手に入る。(一覧表)キャラクター(艦)...ドロップは各章第4ステージと同じ。装備と設計図は、救助信号の発信源探知ウィンドウに表示される「探知感度」により入手できるものがある程度決まる。探知感度を上げるとよりランクの高いものがリストアップされる。潜水艦専用の魚雷を入手できる特定のイベントで入手できるものを除き、潜水艦用魚雷の取得は「救助信号」による。潜水艦の利用には様々な制約があるが、レベルを上げ強力な魚雷を装備することにより短時間で圧倒的な火力を発揮できるようになる。強力な魚雷(の設計図)を入手するには各章の救助信号ステージの中枢艦隊をS勝利で撃破して「探知感度」を上げる必要がある。★5(金色)の設計図は7ステージ、つまり3〜9章の救助信号ステージを全てS勝利でクリアした後でないと手に入らないので、相応の艦隊(目安としてLv95〜)が必要になる。各章第4ステージでのドロップ艦が手に入るこちらはメリットというよりも副産物に近いが、潜水艦用魚雷の設計図と同時にボス限定SR/SSR艦入手の機会を得られる。3章の救助信号ステージなら3-4の赤城、加賀(空母)、6章なら6-4の夕立、8章なら摩耶、10章なら神通。救助信号ステージは何回クリアしても危険度が下がらないが、それでも余裕をもってクリアできるならこちらの方がおいしい、という話。※ただしボス限定ドロップ艦はボス限定のままで変わらない。ハイエンドコンテンツの部類であり、9章を余裕で攻略できるほどの戦力がまだ揃っていなかったり、潜水艦を入手できる特型建造にキューブや資金を割く余裕がない場合は、無理に攻略しなくとも問題ないだろう。潜水艦そのものはこのコンテンツでは入手できない。救助信号海域では、全域において必ず敵潜水艦が出現する。潜水艦にダメージを与えるためにはソナーで発見し、前衛で爆雷を投げつけるか、軽空母に対潜航空機を装備しておく必要がある。注意点として、潜航中の潜水艦を発見できるのは駆逐艦と軽巡洋艦のみ*1で、軽空母は攻撃への参加だけが可能。道中で敵の潜水艦を倒さずに放っておくと他の量産型と同様、画面端へと流れた後で主力に衝突ダメージを与えて消滅する。ソナーの探索範囲で潜水艦が見えたとしても、暗流の外にいた場合は、爆雷を投下をしない。ボスが潜水艦の場合は必ず倒す必要があるため、ソナーと爆雷は忘れずに装備しておこう。ソナーを付け忘れて出撃した場合、残り時間1分でボス潜水艦が浮上してくるまで待つしかないため、戦果Sは取れなくなる。後述するがSクリアが探知感度を上げる条件となるので、救助信号を始めたばかりの人は特に注意が必要だ。白装備・設計図ドロップはボス戦のみなので、道中の護衛艦隊を必要以上に倒すメリットはない。対潜装備は、通常の装備箱からは出ない。勲章で交換するか、救助信号海域でドロップする装備品や設計図が必要。公式説明では「報酬」とあるが、実は中枢撃破時のドロップとなるので、ドロップがない場合もある通常海域のボスと異なり、ドロップなしの確率がそれなりにあるため、装備集めにはかなりの時間がかかる。救助信号海域でドロップする設計図の質は、『探知感度』が上がるほど良くなる魚雷は感度5で紫設計図が、感度8で金設計図がドロップに追加される。ソナー・爆雷投射機は感度5で従来型T3(+改良型T2)の設計図、感度7で改良型T3の設計図がドロップに追加される。ドロップする設計図や白装備は、どの救助海域でも同じ感度8になりさえすれば3章でも金設計図が出るため、まずは本編9-4をクリアし、9章の救助海域を出現させ、そのSクリアを目指そう。10章を現状でクリアする必要はないが、10章救助海域のドロップには白装備が省かれている。出撃してから対潜装備を忘れたことに気付いた場合、またはボス戦でメンバーが脱落してS勝利が取れなくなってしまった場合は、一時停止して撤退してしまおう。海域から撤退しても救助海域は残っているため、仕切り直して何度でも挑戦することができる。