初回限定版のみR1編成仕様の前面パーツが付属。屋根・ノーズ部分もR1編成に対応したものが付属する。通常の前面はワイパー1本(R2~R16編成)が付属。R17編成以降の屋根・妻板形状について説明があるが、この場合は前面のワイパーが2本のものが必要(付属しない)。パッケージ裏面に『R1編成、1次車(2~16)が選択可能』と記載されている。ノーズ部分は閉口状態のみ付属(R1編成・R2~R16編成とも)。このパーツを外した状態でカプラーを装着でき、別売のE5系(Bセット)と連結が可能。マグネットカプラーまたはSHGフレーム付属のドローバーが必要。公式からは推奨されてはいないが、SHGフレーム付属のダミーカプラー(密連)でも連結可能。前面のライト類は表現されていない(ガラスパーツの透明そのまま。R1編成は運転室上部も表現なし)。妻板は編成によって異なるため6種が付属。屋根も同様に12種類が付属。説明書ではR3編成~R16編成までの説明が省略されているが、特記が無ければ『R2、17編成』となっている組み合わせと同様。14(12)号車の窓パーツはE3-1000(2000)系と同じ金型のため切り取るための区切りがなされている。フル編成(5または6両)には2セット必要。R1編成とそれ以外とでは屋根や妻板の形状が異なる。5両編成の場合は14号車(E328-0)を使用しない。E311-0』と書かれているが誤り(16号車はE322-0)。号車番号ステッカーは全ての車両がドアに近い方へ号車番号が来るように貼りつける(説明書とは向きが逆)。ステッカーE3-2000(1000)系・つばさセットと共通(こまちセット対応分のみ表記)。