Serviceを読んで理解し、同意したものとみなします。スタック・オーバーフローはプログラマーとプログラミングに熱心な人のためのQ&Aサイトです。difftoolでwinmergeで差分見るようにしているのですが比較先の一時ファイルがバイナリファイルとして作られてしまっているようで、差分を正常に見ることができません。4:16toshitoshi11gitのバージョンやdifftoolの指定、バイナリと認識されてしまうファイルのファイル名などの情報があるといいかもしれません。