元データ分析の会社で働いていた人の四方山話スマートフォン用の表示で見る元データ分析の会社で働いていた人の四方山話この広告は、90日以上更新していないブログに表示しています。研究室で買ってもらって1ヶ月ほど積読していたこいつが案外いいかも知れない。見るさっき、ふと存在を思い出し、手に取りパラパラとページをめくってみたところ、いいかもしれない、ということに気づいた。今までいろんなものを読んでいたが、発現量まわり全般の知識は結局よく分からず...orzどうやらこの本はR及びBioconductorを用いて、発現量を取得するところから書いているようだ。いうのを求めてたのかも。1章しか読んでいないので何とも言えないけど、しばらくは読み進めていこうと思う。それはそれとして肝心の研究は...新しく設計したFitnessFunctionは、従来のものより精度が低下することが判明した。従来法に比べてより詳細に分類状態を記述し、評価しているのに何でだ!少し分析したところ、overfittingとなっている可能性が高い。Phaseで誤分類に対するペナルティーを大きくしすぎたのかもしれない。ペナルティーを回避しようとして、trainingデータに極端にマッチするような学習をしたようだ。言うことは、ペナルティーを緩和してやればいいのかも。最初に設計したFitnessFunctionは、ペナルティーを考慮していなかった。正確には、分類の状態をそのまま評価していた。すると、わずかに誤分類をしでかしたわずかなマイナスポイントが、たまたまうまく分類できたときの兄弟なプラスポイントにかき消されることとなっていることが発覚。よって、ペナルティーは必要、と。やって、閾値みたいなのを決めだすと、研究者の恣意的な操作でいくらでも結果変えられるやん、って思ってきて嫌なんだけどな。結局のところ、使用している手法が全てparametricなものである以上、この部分からは逃げられない、と。突っ込みの対象でもある、と。Entriesはてなブログをはじめよう!rindai87さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。