Inc.コンテンツへスキップメニュージエンブルについて事業内容サービス一覧サービスの流れニュース採用情報お問い合わせRNA-seq解析RNA-seq解析とは次世代シーケンサー(NGS)を用いて全転写産物の塩基配列を決定することにより、転写産物量を網羅的に推定できるだけでなく、新規転写産物の探索も可能です。選択したプローブの範囲内でしか変化を検出できないマイクロアレイ法に対して、転写産物を直接シーケンスして発現プロファイルを取得するため、全く予想しなかった発現変化も検出できます。アレイ法に比べて高発現でも飽和しにくく感度も高いため、ダイナミックレンジが広く高い定量性を持っています。(DEG)抽出、GO解析を行いました。マッピング結果チトクロムP450ファミリー遺伝子(Cyp1a2)に対するマッピングデータを図示しました。出生後0日肝臓由来RNAのリードカウント(目的遺伝子に由来するRNAの断片数に相当)を青で、10日肝臓由来RNAの結果を赤で、それぞれ2例ずつ、また遺伝子の構造を緑で表示しました。横軸は染色体上の位置を示しています。3)統計検定によりday10で有意に発現量が増加した遺伝子の一部を図示しました。この表はデータ項目を簡略化してあり、実際の納品データとは様式が多少異なります。activityに関するGOタームを持つ遺伝子が有意に高い割合で含まれることが分かりました。新生児期にはmonooxygenaseの一種であるチトクロムP450の種類や発現量が大きく変化すると言われており、そのような変化が検出された可能性が考えられます。RNA-seq解析からはこの様に、細胞集団全体で起こった特徴的な変化を事前予測なしに抽出することが可能です。RNA-seq解析法が用いられます。RNA-seq解析サービスについてはこちらをご覧ください。利用方法の一つとして、多能性幹細胞を分化誘導した細胞を用いた創薬スクリーニングの高効率化が期待されています。ibrutinibは有用な経口白血病治療薬ですが、心房細動を増加させる事が知られています。2.94E-08薬剤未処理群(cont1〜3)と、処理群(drug1〜3)の発現変動遺伝子の一部を示しました。発現変化をヒートマップで一覧表示しました。各サンプルの発現量をZ-scoreで標準化し、発現量が多い遺伝子を赤色、少ない遺伝子を青色、中間を白色で表示しました。図の縦軸は遺伝子、横軸はサンプルを表します。ボルカノプロットによる発現変動遺伝子の可視化ボルカノプロットで発現変動比と統計的有意差を一覧表示しました。各点は遺伝子を表しています。発現変動比と調整済みp値によって分類し色分け表示しました。事項FFPEサンプルも解析可能ですが、サンプル状態により解析できない場合がございます。サンプル量、品質等の問題により、解析をお引き受けできない場合がございます。RNA-seqでターゲットとするRNAサイズについて、22bp前後か、より長いサイズ(〜100bp)も含むかを予めお知らせ下さい。¥30,000※2020年3月30日(月)受注分までの限定価格です。所定の受注数に達し次第終了します。納品方法はダウンロード納品です。ご依頼の解析内容により価格・納期が異なりますので、詳細はこちらよりお問い合わせください。サービスの流れこちらをご覧ください。ご注文方法こちらよりお問い合わせください。受入データを品質検査した結果、解析をお引き受けできない場合があります。