ある、東日本旅客鉄道(JR東日本)・東武鉄道の駅である。停車)と、当駅を終点とする東武鉄道の亀戸線が乗り入れ、接続駅となっている。JR東日本の駅は特定都区市内制度における「東京都区内」に属する。4月5日:東武鉄道の駅が開業。1907年(明治40年)9月1日:総武鉄道が鉄道国有法により買収、国有化[1]。1923年(大正12年)9月1日:関東大震災により損壊[1]。1945年(昭和20年)3月10日:東京大空襲により全焼[1]。1968年(昭和43年)9月30日:都営トロリーバスが廃止。1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化に伴い、国鉄の駅は東日本旅客鉄道(JR東日本)の駅となる[1]。2006年(平成18年)3月24日:駅ビルの名称を「亀戸エルナード」から「アトレ亀戸」に変更する。2007年(平成19年)4月1日:東口を業務委託化[2]。これに伴い業務委託駅となる〈予定〉[3]。島式ホーム1面2線を有する高架駅である。総武本線支線である越中島貨物線は新小岩駅から平井駅までは本線の北側に平行しているが、旧中川を渡った所で高々架となり、当駅のすぐ東側で本線とオーバークロスして南側に移る。貨物線は当駅の西ですぐに、越中島貨物駅へ向かうため南へと離れていく。貨物線を利用して、当駅から小名木川貨物駅まで、さらにはそれ以南に新線を建設して江東区内の南北方向のローカル輸送を担う構想が古くから存在する(江東区LRT事業構想。江東区#交通も参照)。北口にはエスカレーターとエレベーターが、東口は車椅子昇降機が設置されている。島式ホーム1面2線を有する地上駅である。全ての列車が1番線から発着し、2番線は1日朝1本の列車が発着する他は留置線として使用される。そのためワンマン運転用のホームセンサーは1番線のみに設置されている。改札からホームまではスロープで連絡しており、駅ビル「アトレ亀戸」内に改札がある。