Kitの概要ATAC-Seqは、オープンな、すなわちアクセシブルなクロマチン領域を同定することにより、ゲノム全体のエピジェネティックな特徴の解析を可能にする迅速なアッセイです。アッセイの速さ、簡便さ、および幅広いサンプルタイプへの適用性から、ATAC-Seqは詳細なエピジェネティクス解析への入り口として一般的に使用されるアッセイとなってきています。トランスポゼースと反応させます。fragmentationから生まれた造語)と呼ばれる過程において、標的DNAに対するシーケンス用アダプターの標識とDNA断片化を同時に行います。mgの組織または50,000~100,000個の細胞から、16回のIllumina®互換ATAC-Seqライブラリー調製に必要な試薬を含んでいます。最適化されたプロトコールにより、サンプル調製、タグメンテーション、およびライブラリー調製が可能で、シングルフローセルシーケンスでマルチプレックス化できる次世代シーケンサー対応ライブラリーを作成することが可能です。KitのデータこのキットはATAC-Seqを16回実施するのに必要な試薬と酵素を含みます。キットの構成品は効果的に作用するよう最適化され、高品質のATAC-Seqのデータが得られることが検証されています。転写活性の高い遺伝子のプロモーター領域において、クロマチンは一般に開いています。ATAC-Seqアッセイは、これらの位置にピークを見出し、調べているサンプル中のオープンクロマチン領域を明らかにします。Kitを用いた実験結果を示したゲノムブラウザーの画面。ゲノムブラウザーの各トラックは、分裂後ニューロンのマーカータンパク質FOXP3をコードするFoxp3遺伝子の位置を示す。ピークはFoxp3遺伝子のプロモーターにおけるオープンクロマチンを示す。Kitを用いると高品質のデータが得られます。Kitを用いて行われた実験のデータは、公開されているATAC-Seqのデータと非常によく相関します。このことは、このアッセイが安定であり、かつ再現性があること裏付けています。Kitを用いたライブラリーと公開されたATAC-Seqデータの相関。1213-1218)で読まれたピークのRPKM値と、このキットを利用して生成されたGM12878細胞のデータの相関を示している。その相関係数は0.94であり、密接な相関を示している。Kitは、-20°Cおよび4°Cで保管する2種類の温度帯の構成品を含み、それぞれドライアイス上および室温で出荷されます。すべての試薬は適切に保管した場合、受け取り日から6か月間安定であることを保証します。CERTIFICATES。