死者は町方において10月6日の初回の幕府による公式調査では4,394人[22]、10月中旬の2回目の調査では4741人であり、倒壊家屋14346戸とされている。これに寺社領、より広い居住地を有し特に被害が甚大であった武家屋敷を含めると死者は1万人くらいであろうとされる[5]。『破窓の記』には「今度の地震、山川高低の間、高地は緩く、低地は急なり。その謂れ、自然の理有るべし。」とあり、当時から特に揺れの激しい地域の存在が認識されていた[23]。