アニメ第1話「YATにおまかせ!」にほぼ忠実。アニメ第2話「宇宙の穴場!温泉ツアー」に準ずる。アニメ第3話「氷の星で大ピンチ!」に準ずる。アニメ第4話「桂さんの大予言!」にほぼ忠実。アニメ第10話「宇宙海賊ロック参上!」に準ずる。アニメ第14話「超特急!プリンセスを運べ」に準ずるが、ロックが登場する。アニメ第19話「再会!オヤジあらわる?」と第20話「キャプテン・キッドの秘宝!」をベースにしているが、終始惑星アラモで物語が展開。漫画オリジナルのバトル・マリーゴールド号が登場。コミックス・オリジナルストーリー。YATに届いた女性型ロボット・キャナリーにカナビーが一目惚れするが、それはダニエルが送り込んだスパイだった。コミックス・オリジナルストーリー。ゴローの母、ハルカ登場。コミックス・オリジナルストーリー。次元トンネル内で桂に異変。アニメ第37話「アン・マリーゴールドの野望!」に準ずる。ドリスに接近するダニエル。コミックス・オリジナルストーリー。ナナコがデビュー?ヤマモトとプロトタイプ事故のことをゴローが知る。プロトタイプの事故現場に向かったYATとカネア達。ゴローとカネアは異次元へ引き込まれてしまう。アニメ第45・46話に相当。マザーのエネルギーを利用し、ダイゴはプロトタイプを異次元より浮上させる。アニメ第47〜49話に相当。今のままでは命が危ない桂と老人はノア星に戻るため、マザーに残り停止ボタンを押す。アニメ最終話とは逆に、桂がノア星から帰ってきて終わる。YATの物語の17年前、ロック達が海賊時代のヤマモトに拾われ仲間になるエピソード。若き日のアンやボーンズ、ベイツなどが登場。コミックスオリジナルキャラ、キャプテンガークとの戦い。YATの物語の10年前、5歳のゴローがとうちゃんのゴーグルをなくして捜し回る中、桂やカネア、ダニエルと、その日限りの出合いをする。アニメのYATをよく見てないとわからない小ネタも。マザー次元トンネルの事件から2ヶ月後、次元トンネルが使えない中、YATは営業再開。コスモロード社も営業を始めていたが、厳しい経営にうんざりしていたカネアは、ロック達を従え海賊になると言い出す。そんな中、次元トンネルの復旧にあたっていたダイゴが、何者かに誘拐されてしまった。アニメ第1話に準ずる。新しいジャンボを入手する経緯あり。アニメ第3話に相当する。ドツークと同時にサグールが暗躍する。サグ−ルの誘いで向かった先にはブラックホールと3重太陽が。そこに天然の次元トンネルが開き・・・。惑星「ラボ」は、それ自体が巨大なひとつのロボットだった。「ラボ」でカナビーの強化ボディーを手に入れたサグ−ルは、それを改造して作ったアンドロイドのニセ桂をYATに差し向ける。デスガノンにのりこむYAT。ヤマモトは負傷、桂も行方不明、さらに敵には強力なニセ桂「ガツラ」までいる。地球に帰ってきたYAT。マロンはゴロー達と別れて故郷を探す旅に。ガノン帝国との戦い後。モニカを添乗員に、営業を再開したYAT。向いのビルではカネアとダニエルの新生コスモロード社も。そこへ桂が帰ってきて・・・。バラス達が置き去りにされた惑星にロック達がやってきた。3バカはシャレコベック号を乗っ取ろうとするが。